Nature Communications：猪功效基因组学畛域取得紧张停顿

四川农业年夜学动迷信院“猪育种团队”在《Nature Communications》上在线颁发了题为“《猪分歧组织基因转录调控图谱提醒组织个性及转录退化动静》（A Pig BodyMap Transcriptome reveals Diverse Tissue Physiologies and Evolutionary Dynamics of Transcription）”的研讨论文。该研讨为深化解析猪肉质性状造成的分子机理，并为下一步分子育种的展开提供了紧张根底数据和实际撑持，同时也为匆匆进猪作为人类生物学和疾病的生物学模子奠基了根底。

长得快更好吃 捍卫处所猪种

该研讨特殊针对猪紧张经济性状——骨骼肌成长展开研讨。骨骼肌是植物躯体最紧张的构成部门，占到产肉植物体重的约40%。肌纤维作为骨骼肌的次要构成单位，分为慢速氧化型（I型）、疾速氧化型（IIa型）、疾速酵解型（IIb型）与中心型（IIx型）4种，其类型的差别是影响产肉植物肌肉品质的紧张因素之一。过来的年夜量研讨通常将多种骨骼肌视作统一类组织，对于分歧部位骨骼肌的和转录调控个性并未有精密、深化地探求。

本次研讨应用空间转录组学技术，从单根肌纤维分辩率的程度提醒了I、IIa和IIb三种分歧肌纤维亚型的在能量代谢、膨胀才能等分歧心理个性下的转录组差别。在我校植物医学院剖解学业余陈正礼传授的协助下，进一步完全构建了从头部、前肢、躯干到后肢，共47种分歧部位骨骼肌的精密转录调控图谱，并明白了其在能量代谢和膨胀个性等方面的分子调控差别，将为农业植物产肉性状提供紧张指导。

另一方面，我国处所猪种广泛具备肉质低劣，但产肉性能欠安的特色，“与本国猪相比，中疆土猪的成长速率更慢，瘦肉率更低。若何充沛迷信应用我国丰厚处所猪种资本，培养统筹成长性能和瘦肉率的新种类（系），特殊是在低背膘厚条件下维持适宜的肌内脂肪含量，以确保肉质低劣，也是以后农业植物育种畛域存眷的热门和难点。”

“猪肉的脂肪分皮下脂肪、肌间脂肪、肌内脂肪三种。通常，咱们说的这块肉太肥，指的是皮下脂肪太厚，而猪肉好吃的症结，要看肌内脂肪含量。”金龙引见说。

该研讨在现有猪参考基因组根底上，弥补欠缺正文了年夜量调控性转录本，包含19072个lncRNA （长链）， 2440个TUCPs （未知编码潜能转录本）， 48232个circRNAs （环状RNA）和1245个 （小RNA）。同时采取高通量染色质空间构象捕捉技术（Hi-C）重构了猪脂肪组织的三维基因组空间构造，在二维的“线性”根底上，提供了基因调控的三维“空间”信息，为下一步分子育种的展开提供了紧张根底数据和实际撑持。(100yiyao.com）