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研讨职员提醒肝癌代谢异质性相关分子分型及潜在生物学机制

中国迷信院年夜连化学物理研讨所中科院拆散阐发化学重点试验室研讨员朴海龙团队,在后期对卵白质泛素化及去泛素化互相作用研讨根底上(Oncogene,2020;iScience,2019),进一步应用及机械培训办法,基于代谢物-卵白质互相作用网络和癌症多组学数据界说了在代谢方面具备显着差别性的肝癌亚型,并提醒出分歧亚型在预后、免疫、微情况、甲基化调控等多个方面的特同性生物学特征。

代谢重编程是癌症焦点特征之一,其作用不仅体当初代谢通路变动,还可以通过代谢物-卵白质互相作用传达到其他生物学进程。研讨职员基于代谢物-卵白质互相作用网络和肝癌多组学数据,综合应用简单网络和机械培训阐发办法,辨认了两种在疾病预后具备显着差别性的肝癌亚型。研讨发现,在代谢方面,预后较差的亚型与缺氧、代谢酶的高度甲基化、泛滥代谢通路的下调及多种脂肪酸的累积相关。此外,泛滥免疫相关通路在预后较差的亚型中出现显着上调趋向。研讨职员进一步通过代谢物-卵白质互相作用预测发现,不饱和脂肪酸与多个免疫调控卵白(例如SRC和CTLA4)存在潜在互相作用,不饱和脂肪酸的累积能够是免疫通路上调的潜在起因。上述肝癌亚型及其生物学特征在多组自力的肝癌行列步队上获得验证。从外,研讨职员应用肝癌细胞系,通过转录组学和代谢组学试验验证了次要盘算阐发成果。该研讨为精准医疗提供了紧张线索。(100yiyao.com)

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