基因组测序证明长江流域为中国李原始驯化中间 |
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起源:郑州果树研讨所 2021-09-14 12:36
中国李是天下上贸易化栽培最普遍的李种之一,顺应性强,具备较高的经济代价与生态代价。近日,中国农业迷信院郑州果树研讨所李杏种质改进团队与桃种质资本团队结合破译了中国李高质量基因组,为其紧张经济性状改进奠基遗传学根底,相关结果9月2日颁发于《动物学杂志(The Plant Journal)》。据黄振宇博士引见,研讨团队起首应用二代、三代及中国李是天下上贸易化栽培最普遍的李种之一,顺应性强,具备较高的经济代价与生态代价。近日,中国农业迷信院郑州果树研讨所李杏种质改进团队与桃种质资本团队结合破译了中国李高质量基因组,为其紧张经济性状改进奠基学根底,相关结果9月2日颁发于《动物学杂志(The Plant Journal)》。
据黄振宇博士引见,研讨团队起首应用二代、三代及Hi-C等测序技术绘制了李杏种质改进团队自立选育种类‘中李6号’基因组图谱,其组装质量为现有最优,为深度解析中国李基因组变异纪律、分子育种及优异基因开掘奠基了紧张根底。
在此根底上,该研讨又进行了全基因组高妙度重测序数据阐发,共鉴定到3,380,659个高质量SNPs,将74份中国李焦点种质聚类为南、北、西南及国外种类群,发现北方种类群较为原始,遗传多样性丰厚,且与其他种类群间存在基因交流,从学层面再次证明我国长江流域为中国李原始驯化中间。
中国李顺应性极强,在我国南至广东省、北至黑龙江省,均有年夜面积栽培,但对于其顺应性机制鲜有报道。研讨对分歧种类群间进行选择压阐发,共鉴定到35个受选择位点,此中,着花调控、抗病抗逆及类黄酮代谢等紧张路径症结基因显着富集,此外,基因家族的扩张和膨胀阐发标明,以上几类基因家族在基因组退化进程中显着扩张,初步提醒了中国李紧张性状驯化的分子根底,为后续开掘中国李顺应性相关优异基因提供紧张参考。(100yiyao.com)
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