CANCER IMMUNOL IMMUN :没有证据标明HLA基因型会影响癌症患者中产生的驱动渐变

起源：100医药网 2021-09-22 15:13

免疫体系曾经退化到可以辨认由病原体感化、体细胞渐变和畸形卵白质惹起的异常分子和非本身分子，次要组织相容性复合体(MHC)在这个进程中起着症结作用。

免疫体系曾经退化到可以辨认由病原体感化、体细胞渐变和畸形卵白质惹起的异常分子和非本身分子，次要组织相容性复合体(MHC)在这个进程中起着症结作用。MHC分子分为I类(MHC-I)和II类(MHC-II)，在人类中由6号染色体上的一组基因编码，编码本身卵白基因中的体细胞渐变会招致氨基酸序列产生改动，从而发生所谓的新抗原，这些抗原有能够在MHC呈递给T细胞时引发免疫反馈，通过是杀死携带免疫原性的新抗原细胞。癌症回避免疫反馈的机制之一是得到改动抗原呈递的渐变，抗原呈递到免疫细胞的进程中，最具选择性的步调是抗原肽与MHC的联合。

图片起源：https://doi.org/10.1007/s00262-021-03028-w

该研讨从新阐发了来自两项备受注目的研讨的数据，这些研讨申报称可以通过患者的MHC分子联合由此发生的新抗原的才能来预测在癌症患者中发现的驱动渐变，思索到患者的HLA基因型，患者谐波均匀最佳品级(PHBR)评分被发起作为掂量源自体细胞渐变的新抗原是否可以被MHC分子联合的指标。但研讨者发现两篇论文的论断，即癌症驱动渐变优先呈现在患者在MHC分子上出现新抗原的才能的差距中并不行靠，而且数据中没有证据标明在患者中看到的驱动渐变受患者I类或II类MHC基因型的影响。

一切驱动渐变的log PHBR-I分数的散点图以及评分的中位数和四分位间距 图片起源：https://doi.org/10.1007/s00262-021-03028-w

研讨者对MHC出现癌症驱动渐变的预测才能在有和没有渐变的患者之间进行了比拟，呈现驱动渐变的患者的PHBR评分较高，标明驱动渐变优先呈现在缺乏可能将它们呈递给T细胞的MHC等位基因的患者中。在这些PHBR评分组的比拟中，一组（渐变组）由存在渐变的患者的驱动渐变评分构成，另一组（无渐变组）由没有渐变的患者的驱动渐变的PHBR评分构成；在这些比拟中，给定的驱动渐变可以在渐变组中呈现屡次（每个产生它的患者一次），但这是有成绩的，渐变的PHBR分数高度相关，是以数据点不是自力的。该研讨发现渐变组和无渐变组之间的差别理论上与MHC基因型在患者之间随机化时一样年夜，标明这种差别不是由患者基因型驱动的；而且在比拟按驱动渐变频率分组的PHBR分数时，没有发现一致的差别。先前报道的驱动渐变与免疫表示评分之间的强联系关系可以用少数具备高PHBR评分的高频率驱动渐变来解释（是以HLA等位基因不克不及很好地出现），这可以通过驱动渐变产生频率（在驱动渐变频率的区间内）和区间中的中位数PHBR-I分数之间的显著相关性来阐明。

中位PHBR-I和PHBR-II分数的对数与驱动渐变频率（跨患者）之间的关系 图片起源：https://doi.org/10.1007/s00262-021-03028-w

在I类HLA基因型的100次随机分组中，随机数据中渐变组的PHBR-I评分中位数理论上超过了真实数据中渐变组中位数的94倍（差别无统计学意义；p=0.12用于两组之间PHBR-I分数差别的基于两侧随机化的测试）；异样，对II类HLA基因型进行混洗时，混洗数据中渐变组的PHBR-II得分中位数超过真实数据的36倍，各组之间的中位数得分没有显著差别(p=0.72)。是以，渐变组和无渐变组之间PHBR评分的比拟并没无为驱动渐变优先产生在具备无奈联合所发生的新抗原的MHC分子的患者中的假如提供任何支持，而且复发率最高的癌症驱动渐变中分歧基因的数目仍旧更少。研讨者在阐发之前研讨使用的渐变内模子时发现，对“渐变内模子未能检测log PHBR-I对驱动渐变概率的影响是由于免疫呈递对渐变概率的影响被随机效应捕捉”的解释并不是一个强无力的证据，由于中值PHBR分数并不克不及解释癌症患者驱动渐变频率的差别（要是有的话）。虽然先前的研讨中包含了1018个驱动渐变，但它们仅与168个分歧的基因相关，基于对来自雷同基因的1000对随机采样的生殖系渐变对的阐发，研讨者发现统一基因中渐变的PHBR分数呈正相关，这能够反映了卵白质的氨基酸或构造域含量。

该研讨对来自TCGA的癌症驱动渐变进行了从新阐发，没有证据标明免疫反馈施加的选择会影响在癌症中察看到的驱动渐变。这一成果弥补了比来报道的在癌症中察看到的体细胞渐变中新抗原总体缺乏的不敷，然而，MHC在细胞外表呈递新抗原的才能仍有能够对在癌症中察看到的驱动渐变有显明影响，但这种才能并没有被PHBR评分充沛捕获。MHC基因型与驱动渐变含量之间缺乏联系关系标明，要是免疫体系在癌症预防中起次要作用，那么这并不波及以强烈依赖于MHC基因型的方式预防特定驱动渐变。（100医药网 bioon）

参考文献

Noor Kherreh et al. . Cancer Immunology, Immunotherapy (2021 Aug 21) doi：https://doi.org/10.1007/s00262-021-03028-w

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