Nature：迷信家实现单细胞分辩率下小鼠脑DNA甲基化图谱

起源：科技部生物中间 2021-10-21 12:27

哺乳植物脑细胞在基因表白、剖解和功效方面表示出显着的多样性，但这种普遍异质性背地的调控方式尚不分明。近日，来自美国的科研团队在《Nature》杂志颁发了题为“DNA methylation atlas of the mouse brain at single-cell resolution”的研讨结果，通过单核DNA甲基化

哺乳植物脑细胞在基因表白、剖解和功效方面表示出显着的多样性，但这种普遍异质性背地的调控方式尚不分明。近日，来自美国的科研团队在《Nature》杂志颁发了题为“DNA methylation atlas of the mouse brain at single-cell resolution”的研讨结果，通过单核DNA甲基化测序对小鼠多个脑区的特征进行了图谱化阐发。

研讨职员对小鼠年夜脑皮层、海马、纹状体、惨白球和嗅觉区的45个区域的103982个细胞核（包含95815个神经元和8167个非神经元细胞）进行了全面的表观基因组评价。鉴定了161个具备分歧空间地位和投射目的的细胞簇。他们构建了这些表观类型的分类，并用标志基因、调控元件和转录因子进行正文。研讨发现皮质和海马兴奋性神经元的DNA甲基化环境沿空间梯度不时变动。应用这个深度数据集，研讨职员构建了一个可以准确预测单个神经元细胞类型辨认和年夜脑区域空间地位的人工神经网络模子。将高分辩率DNA甲基组与单核染色质可及性数据相联合，可以预测一切已鉴定细胞类型的高置信度加强子-基因互相作用，随后通过细胞类型特同性染色质构象捕捉试验进行验证。

总之，研讨职员通过联合来自单个细胞核的多组数据集（DNA甲基化、染色质打仗和开放染色质），并正文小鼠年夜脑中数百种细胞类型的调控基因组，该DNA甲基化图谱刻画了整个小鼠年夜脑神经元多样性和空间组织的根底。(100yiyao.com）

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