中国热科院牵头宣布椰子高质量基因组

起源：中国热科院 2021-11-12 12:50

近日，中国热科院椰子研讨所作为第一实现单元，结合海南年夜学、广西年夜学、华北理工年夜学科研团队，在国内学术期刊 Genome Biology（影响因子：13.58；中科院一区）上颁发题为“High-quality reference genome sequences of two coconut cultivars provide insights i

近日，中国热科院椰子研讨所作为第一实现单元，结合海南年夜学、广西年夜学、华北理工年夜学科研团队，在国内学术期刊 Genome Biology（：13.58；中科院一区）上颁发题为“High-quality reference genome sequences of two coconut cultivars provide insights into evolution of monocot chromosomes and differentiation of fiber content and plant height”的研讨论文。该研讨绘制了两个参考级别椰子基因组，联合变异组学、转录组学、代谢组学以及细胞学等，提醒了票据叶动物染色体的退化进程和椰子染色的造成历程；阐发了高矮两种椰子耐盐性、株高、纤维和脂质含量等症结性状差别的根底，同时发当初椰子退化进程中，约在400万年前自然产生的“绿色反动”。构建了高、矮种椰子基因组精密图谱，此中高种椰子基因组年夜小为2.39 Gb，矮种椰子基因组年夜小为2.40 Gb。

该研讨基于椰子、紫萍、菠萝等基因组的共线性关系，从新构建了含有10条染色体的古票据叶动物基因组核型，并对椰子基因组核型的退化路线进行了揣摸。该研讨提出的新的模子，分歧于先前的研讨成果（5条或7条染色体），对解释票据叶动物核型变动甚至被子动物的退化汗青都提供了新的概念和研讨偏向。

并进一步应用叶间距表型进行全基因组联系关系阐发，鉴定出了12号染色体上GA20ox基因与椰子株高显着相关，并存在拷贝数变异（CNV）；并整合多种伎俩验证了GA20ox以及赤霉素代谢路径在高矮种的差别招致了高矮种椰子的株高差别。该成果标明在椰子的退化进程中，年夜约在400百万年前自然产生了“绿色反动”。(100yiyao.com）

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