基于天河超等盘算机的新冠药物挑选单干研讨结果入围国内戈登贝尔奖评比 |
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起源:中山年夜学 2021-11-17 21:53
美国盘算机协会(ACM)颁布,由中山年夜学药学院、海南年夜学药学院、国防科技年夜学盘算学院、国度超等盘算天津中间、中国陆地年夜学医药学院、美国肯塔基年夜学药学院等单元构成的结合团队,在天河新一代超等盘算机上实现的“基于自在能微扰-相对联合自在能办法(FEP)的年夜规模新冠药物虚构挑选”任务胜利入围2021年度的戈登贝尔新冠特殊奖,这是我国初次入围该奖项。中山年夜学药学院罗美国盘算机协会(ACM)颁布,由中山年夜学药学院、海南年夜学药学院、国防科技年夜学盘算学院、国度超等盘算天津中间、中国陆地年夜学医药学院、美国肯塔基年夜学药学院等单元构成的结合团队,在天河新一代超等盘算机上实现的“基于自在能微扰-相对联合自在能办法(FEP)的年夜规模新冠药物虚构挑选”任务胜利入围2021年度的戈登贝尔新冠特殊奖,这是我国初次入围该奖项。中山年夜学药学院罗海彬传授、肯塔基年夜学湛昌国传授、中国陆地年夜学王鑫传授为该论文的并列通信作者;中山年夜学药学院李哲副传授、国防科技年夜学吴诚堃副研讨员、李翊谁博士生、中山年夜学药学院刘润铎研讨生为该论文独特第一作者。
该结果由中国迷信院上海药物所陈凯先院士、北京航空航天年夜学钱德沛传授和荷兰阿姆斯特丹年夜学Hans Westerhoff传授提名保举。研讨通过应用天河新一代超等盘算机的超年夜规模算力,使用国内当先的药物-靶标联合精准评估盘算办法,完成了新冠应急药物(无效下降致死率和重症率)的疾速挑选和发现。团队以新冠病毒的M-Pro和TMPRSS2等紧张靶点为研讨工具,对起源于美国(食药监局)同意上市及成熟贸易库的近180万种小分子与靶点的复合物进行盘算评估,在一周内实现了50余万个简单分子能源学模拟工作,并挑选出98个化合物,此中50个化合物在生物活性测试中表示出较高活性,射中率到达51%,属于以后国内当先程度。后期在广州超算、天津超算、腾讯云等支持下盘算挑选获得的应急药物双嘧达莫已实现100多例的,成果显示:双嘧达莫干涉三周后,新冠重型患者临床症状显明改善,入院率到达87.5%,显着优于对照组40%的入院率;且无灭亡案例,无转成危重型案例,标明该药能进步治愈率并下降病亡率。该药与抗病毒药阿比多尔合用后,新冠一般型患者的入院率为100%,均匀入院光阴为7天,比单用阿比多尔提早了4天,显示出优越的医治后果。
依据理论测算,在天河新一代超等盘算机的撑持下,基于自在能微扰-相对联合自在能办法的药物挑选效能提升了200倍。该项结果关于完成针对突发疫情的疾速药物相应,具备极为紧张的事实意义和指导意义。
戈登贝尔奖是国内上高性能盘算利用畛域的最高学术奖项,被称为“超算畛域的诺贝尔奖”,每年由ACM评比和发表,具备较年夜的国内影响力。因为新冠疫情的暴发,2020年,ACM初次设立了戈登贝尔奖新冠特殊奖(ACM Gordon Bell Special Prize of HPC-based research),表彰在“超算抗疫”方面取得的卓越研讨结果。该奖项评估的次要尺度为:通过高性能盘算的利用和立异,对懂得疾病实质、节制疾病传达或发现无效医治伎俩做出紧张奉献。2020年该奖项有6项结果入围,全体被美国包揽。( bioon)
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