复旦大学附属中山医院团队研发的肝癌早期筛查模型令人惊叹 |
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来源:奇点蛋糕2022-01-18 08:44
在中国,平均每小时有47人被诊断为肝癌,其中45人会死于肝癌。由于发病隐匿,进展迅速,80%的肝癌患者确诊时处于中晚期,五年总生存率不足20%,而如果早期诊断和治疗,五年生存率将超过60%[2]。因此,肝癌的早期筛查和早期诊断非常重要。目前,传统的肝癌筛查方法,肝脏影像学和血清甲胎蛋白(AFP)检测,都不尽如人意。细胞外游离脱氧核糖核酸
在中国,平均每小时有47人被诊断为肝癌,其中45人会死于肝癌。
由于发病隐匿,进展迅速,80%的肝癌患者确诊时处于中晚期,五年总生存率不足20%,而如果早期诊断和治疗,五年生存率将超过60%[2]。因此,肝癌的早期筛查和早期诊断非常重要。目前传统的筛查手段,肝脏影像学和血清甲胎蛋白(AFP)检测,都不尽如人意。
细胞外游离DNA(cfDNA)是细胞死亡后释放到血液中的DNA片段。CfDNA携带了来源组织细胞的特征,因此可以用于肿瘤检测[3]。这就像捡掉在地上的落叶来推断一棵树的种类。CfDNA检测快速、实时、微创、方便。
近日,复旦大学附属中山医院贾凡院士、周建教授、王政教授团队对肝癌患者的cfDNA进行了低深度全基因组测序,并根据肝癌cfDNA的测序特点,利用机器学习建立了肝癌早期筛查模型。区分非癌和非癌的AUC达到0.995,敏感性高达96.8%,特异性为98.8%,预测性能优异[4]研究成果已在线发表在顶级肝病杂志《肝病》上。
首先,研究人员招募了716名受试者:381例原发性肝癌和335例非对照(104例乙肝/肝硬化和231例健康人)。
根据病理和临床特征,受试者被随机分为训练队列(362例)和验证队列(354例)。为了真实模拟肝癌的实际发病率,两个队列中的亚型分布与现实世界中的比例一致。
随后,研究人员提取了受试者的血浆cfDNA,并对全基因组进行了低深度测序,获得了cfDNA片段基因组学的特征。
考虑到与非癌症人群相比,癌症患者短cfDNA片段的比例更高[5]。研究人员利用短cfDNA片段的两个相关特征,即片段大小分布(FSD)和片段大小比(FSR),在训练队列中进行机器学习,并构建了三个基本子模型,在验证队列中进行验证,最终集成到筛选模型中。
整合筛选模型后,研究人员在验证队列中对其进行了系统验证。
结果表明,集成模型的筛选性能优越,AUC为0.995,灵敏度高达96.8%,特异性为98.8%。区分肝癌患者和肝硬化/乙肝患者,表现依然出色,特异性达到96.1%。区分患者和健康人的预测性更好,特异性达到100%!
这意味着这种肝癌早期筛查模式,在受试者中,几乎是正确的。
病理学上,肝癌主要分为肝细胞癌(HCC)、肝内胆管细胞癌(ICC)和混合型(cHCC-ICC)。它们在发病机制、生物学行为、治疗方法和预后等方面存在较大差异,不能平等对待[6]。那么,这个预测模型在不同的子群中会有怎样的表现呢?
研究人员检查了验证队列。结果显示,早期筛查模型对不同病理类型的预测性能依然优异:HCC检测的灵敏度为96.2%,而ICC和cHCC-ICC的灵敏度高达100%!
HCC占肝癌的绝大多数,而ICC和cHCC-I
然后,研究人员根据临床分期、甲胎蛋白、总胆红素水平、大小和数量等不同标准将肝癌分组,并在亚组中评估早期筛查模型。
结果显示,该模型在极早期肝癌(TNM IA /BCLC 0 /CNLC Ia)、AFP阴性(20ug/L)、低总胆红素、低白蛋白和小肝癌(3cm)亚组中的预测性能持续优异!此外,与传统筛查标志物AFP(AUC 0.781)相比,该模型的预测性能更为优异(AUC 0.985),能够有效弥补传统方法的不足,显著提高筛查效果。(100yiyao.com)
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