莴苣miRNA研究的新进展

来源：北京市农林科学院生物研究所，2022年1月19日08:29

近日，北京农林科学院生物研究所与信息中心在《植物科学前沿》(影响因子5.753/Q1)上联合发表了一篇题为《微RNA在字母中的综合注释强制性功能探索》的文章。植物miRNA是一种转录后调控

近日，北京农林科学院生物研究所与信息中心在《植物科学前沿》(5.753/Q1)上联合发表了一篇题为《小微RNA在活版中的综合注释强制性功能探索》的文章。

植物是一类转录后调控基因表达的因子，在植物生长发育、环境响应等方面发挥着重要作用。在作物中，许多重要农艺性状的形成与miRNA有关。多组学数据的丰富积累使得构建以miRNA为核心的调控网络成为可能。然而，在重要的叶菜生菜中，相关的研究还是空白。

本研究在前期莴苣基因组分析的基础上，通过对莴苣不同组织中的小RNA进行深度测序，鉴定出67个家族中157个高置信度miRNA。通过预测和降解物测序分析结果，综合鉴定了3629个miRNA靶基因，并用RNA-seq方法建立了这些靶基因的表达谱。此外，调节miRNA的上游转录因子是通过。整合这些数据，我们构建了以miRNA为核心，结合上游转录因子和下游调控基因的基因调控表达网络。该网络以前馈环路为参考单元，极大地丰富了对miRNA调控网络的原有认识，发现了已知调控模块与未知调控模块之间的许多新联系。

为了进一步验证这些新发现的调控模块的功能，本工作验证了生菜miR408(Lsa-miR408)与其三个铜相关蛋白基因(LsaBBP、LsaBCP、LsaPAA2)之间的调控关系。结果表明，这三个目的基因在过量表达Lsa-miR408的生菜中的表达水平显著降低。同时，高表达植株表现出叶柄长度、生物量和种子大小显著增加的表型，说明Lsa-miR408具有增加生菜鲜重和种子大小的功能。(100yiyao.com)

版权声明

本网站标注“来源：百医网”或“来源：bioon”的文字、图片、音视频资料均属于百医网网站版权所有。未经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，否则将承担责任。获得书面授权转载时，必须注明“来源：百医网”。其他来源的文章均为转载。本网站所有转载都是为了传递更多信息。转载不代表本网站的立场。不想被转载的媒体或个人可以联系我们，我们会立即删除。

87%的用户在随时阅读、评论、分享百医网APP。请扫描二维码下载-