细胞:人体内潜伏着多少病毒？

来源：生物世界2022-09-30 08336038

噬菌体研究正在复兴，这个高质量、大规模的肠道噬菌体数据库(GPD)的建立将为那些研究噬菌体及其在调节肠道细菌和自身健康中的作用的研究人员提供丰富的资源。

像其他哺乳动物一样，人体被包括细菌、病毒和真菌在内的数万亿微生物占据，这些微生物统称为共生菌群。从某种意义上说，人是人体和共生细菌的复合体。

人体肠道内寄生着大量的细菌。这些肠道菌群的失衡影响着人类的肥胖、肠炎、自身疾病、对抗癌药物的反应，甚至影响着人类的寿命。因此，有必要了解人体肠道细菌和感染这些细菌的噬菌体在人体健康和疾病中的作用。

世界最著名的基因组测序研究中心之一惠康桑格研究所的特雷弗d劳利(Trevor D. Lawley)在《细胞杂志》上发表了一篇题为《人类肠道噬菌体多样性的大规模扩张》的研究论文。

研究团队通过挖掘全球28060个人类肠道宏基因组和2898个人类肠道细菌基因组，建立了包含142809个噬菌体的肠道噬菌体数据库(GPD)，其中超过一半是以前从未发现过的新病毒。

这项研究建立了迄今为止最大、最全面的人类肠道噬菌体数据库，为更好地了解病毒在肠道微生物组中的作用铺平了道路，也有助于发现治疗耐药细菌感染的新方法。

噬菌体是一类感染细菌、古细菌等微生物的病毒的总称。噬菌体必须寄生在活菌体内，具有严格的宿主特异性，这取决于噬菌体吸附器官和受体细菌表面受体的分子结构和互补性。噬菌体是最常见和分布最广的一组病毒。它聚集在一些充满细菌群落的地方，如土壤、动物和人的肠道，有丰富的噬菌体。

这项研究确定了一组具有共同祖先的新病毒，并将其命名为Gubaphage，这是人类肠道中病毒进化的第二大分支，仅次于2014年发现的crAssphage。这两种病毒似乎都感染相似类型的人类肠道细菌，但这种新发现的古巴噬菌体的具体功能和作用需要进一步研究和发现。

据研究团队介绍，这项研究有严格的质量控制流程和机器学习方法，因此可以最大限度地减少污染，获得高度完整的病毒基因组。

这种高质量的病毒基因组为更好地了解病毒在肠道微生物群中的作用铺平了道路，并有助于发现新的治疗方法，例如使用噬菌体作为抗菌剂来消除耐药细菌。

2019年5月，《自然医学》发表论文。一个感染了罕见的结核分枝杆菌的小女孩，在濒临死亡和绝望的情况下，接受了基因工程噬菌体治疗。噬菌体成功消灭了感染她的细菌，把她从死亡的镰刀上拉了回来。

总体而言，研究团队通过挖掘全球28060个人类肠道宏基因组和2898个人类肠道细菌基因组，建立了最全面、最完整的人类肠道噬菌体数据库(GPD ),包含约142809个噬菌体，其中一半以上是从未发现过的新病毒。

如今，噬菌体研究正在复兴。这一高质量、大规模的肠道噬菌体(GPD)数据库的建立，将为研究噬菌体及其在调节肠道细菌和自身健康中的作用的研究人员提供丰富的资源。

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