研究人员鉴定槟榔DOF基因家族成员参与幼果脱落过程的调控 |
来源:中国热科院2022年10月26日14:11
近日,中国热科院椰子研究所槟榔果实脱落调控研究取得新进展。首次在基因组水平上系统鉴定了槟榔DOF基因家族成员,并提出了其与槟榔果实早期脱落过程的关系。本研究将进一步分析槟榔果实脱落的分子调控机制。
近日,中国热科院椰子研究所槟榔果实脱落调控研究取得新进展。首次在基因组水平上系统鉴定了槟榔DOF基因家族成员,并提出了其与槟榔果实早期脱落过程的关系。该研究为进一步分析槟榔果实脱落的分子调控机制奠定了基础。
槟榔是海南重要的经济作物,幼果异常脱落严重影响产量,是槟榔种植业亟待解决的问题。许多环境和发育信号触发果实脱落。研究组通过转录组分析发现,DOF基因家族成员的表达水平在幼果脱落过程中发生了显著变化。DOF(DNA binding with one finger)基因家族是植物中一类独特的转录因子,属于锌指超家族。本研究对槟榔AcDOFs全基因组进行了分析,包括其基因结构、系统发育关系、启动子区域、染色体位置和共线性。同时观察了槟榔果实脱落前后脱落层细胞结构的变化,比较了槟榔果实脱落层AcDOFs基因的转录水平。在果实脱落层鉴定出6个关键ACD of,其中3个ACD of被进一步鉴定为与果实脱落过程相关的关键基因。
此外,以TF(转录因子)为中心的酵母单杂交技术用于筛选出33个可能被关键基因AcDOF4识别和结合的基序。这些模体存在于一些已知的与脱落相关的基因启动子区域,包括编码纤维素合成酶、果胶甲基酯酶、多聚半乳糖醛酸酶、伸展蛋白等的基因。与预测一致,这些基因在即将脱落和未脱落果实的脱落层中的表达存在显著差异。上述结果为进一步研究槟榔DOF家族基因的生物学功能和分析槟榔果实脱落的分子调控机制奠定了基础。
槟榔果实脱落细胞的形态分析
图形共线性分析
该成果发表于《International Journal of Molecular Sciences》,题目为《槟榔幼果ab筛选涉及的dove基因家族的全基因组鉴定》,中国热科院椰子研究所助理研究员李佳为本文第一作者,中南林业科技大学Tommy副教授为通讯作者。这项工作得到了海南省重点研发项目基金的支持。
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