Nat Methods |
北京大学谢晓亮及斯坦福大学Longzhi Tan共同通讯在Nature Methods在线发表题为 Simultaneous single-cell three-dimensional genome and gene expression profiling uncovers dynamic enhancer connectivity underlying olfactory receptor choice 的研究论文,该研究提出了 连接mRNA到染色质结构(LiMCA) ,它以特殊的灵敏度和低输入材料联合描绘了3D基因组和转录组。
结合LiMCA和高分辨率scATAC-seq分析,METATAC,研究人员成功地表征了染色质可及性,以及配对的3D基因组结构和基因表达信息,个体发育中的嗅觉感觉神经元。该研究扩大了已知嗅觉受体(OR)增强子的范围,并发现了其动力学的意想不到的规则:OR基因及其增强子在早期分化中最容易获得。此外,还揭示了OR和增强子之间的动态空间关系。这些发现为ORs和增强子的3D连接如何动态协调 一个神经元-一个受体 选择过程提供了有价值的见解。
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