Cell:戴琼海/郭增才/吴嘉敏开发介观活体显微仪器RUSH3D,可全景观测哺乳动物大规模细胞间交互行为 |
RUSH3D成像效果(Credit:Cell)
RUSH3D系统集成了团队前期一系列成像与智能技术理论和关键技术成果,基于扫描光场成像原理,能够实现轴向400微米范围的高速三维成像的同时并具备低光毒性。针对光学像差会严重影响系统成像的分辨率, RUSH3D通过获得全视场超精细的四维空间角度数据,构建了基于波动光学的数字自适应光学架构(wDAO),无需在光学系统中增加额外的波前传感器或者空间调制器,在后端即可完成大视场多区域自适应光学像差矫正,从而提升大视场复杂环境三维成像的空间分辨率以及信噪比。这一设计使得仅需常规尺寸物镜,就能有效克服空间非一致的系统像差和样本像差难题,实现了全视场内均一高空间分辨率的十亿像素成像,显著降低介观成像系统尺寸与成本,使得高分辨活体介观显微成像系统变得更加广泛可及。除此之外,活体荧光成像中背景荧光严重影响了成像的信背比,RUSH3D采用多尺度去背景算法实现背景信号和在焦信号的分离,的滤除散焦背景,从而提升成像信背比,恢复淹没在荧光背景中的荧光信号。进一步与共聚焦扫描光场融合,将能在具备高通量介观观测能力的同时,实现共聚焦的成像保真度。
大规模在体三维神经记录
RUSH3D通过其跨时空的多尺度成像能力,极大拓宽了科学家对大脑的认知。大脑皮层的神经元网络被认为是高等动物神经系统中十分重要而又复杂的信息处理中心,是产生生物智能乃至意识的关键神经网络区域。然而,由于观测技术限制,目前大部分研究只能同时记录实验动物中一个或几个皮层区域的神经元活动,难以进一步研究皮层神经元网络的联合动态变化。
通过RUSH3D大视场、三维高分辨率、高帧率的成像优势,交叉团队开创性实现了对头固定下清醒小鼠背侧皮层17个脑区中十万量级大规模神经元的长时间高速三维记录,并且能够对同一群神经元进行跨天连续的追踪。运用该系统,证实了响应感觉刺激,调控运动的神经元并非只存在于单一感觉皮层、运动皮层,而是广泛存在于皮层各个区域,但各个区域神经元对感觉信息编码、整合、区分的能力存在差异。进一步发现自发运动行为发起时,小鼠皮层神经元网络由尾侧向鼻侧传导的发放模式。
这一结果提示视觉、触觉等感觉皮层神经元的信息整合和全皮层范围信号扩散可能是引起自发运动的关键因素。在此基础上,RUSH3D有望首次实现解析全背侧皮层的介观脑功能图谱,通过捕捉大脑内的成百上千万神经元间的动态连接与功能,有望能揭示意识的生物学基础,智能的本质等人类基本问题,推动对神经退行性疾病的研究,并有望推动脑启发的人工智能发展。
全脑皮层神经成像(Credit:Cell)
数十小时连续观测小鼠淋巴结范围免疫反应
RUSH3D系统为研究大规模细胞交互提供了前所未有的工具。例如,生发中心(Germinal center, GC)是被抗原激活后的B细胞在趋化作用引导下聚集形成的组织结构,对于自身免疫性疾病、疫苗、病毒感染等过程都至关重要。由于受到视场和拍摄时长的限制,免疫细胞如何参与多个GC生成以及如何在多个GC间进行迁移的过程从来没有被连续记录过,从而限制了该领域的发展。团队利用RUSH3D对小鼠腹股沟附近淋巴结在免疫反应85个小时左右进行了长达十数小时的高速三维成像,完整记录了B细胞参与多个GC生成的过程。与此同时,观测到在免疫反应145个小时GC已经完全形成之后,一些T细胞在多个GC之间完整迁移的过程,预示了T细胞可能参与了GC之间的信息交流和传递。这些对信使T细胞在不同生发中心之间交流信息的观测有望带来我们对免疫过程的全新认识。
B淋巴细胞参与小鼠淋巴结多个生发中心形成的完整过程(Credit:Cell)
T淋巴细胞在多个生发中心之间迁移的完整过程(Credit:Cell)
跨尺度精准解析,医学研究的革命性工具
跨时空的多尺度成像能力使得RUSH3D极大提升了实验效率。例如,药物筛选实验能够在单次实验中显著提高效率,免去多次试验需求。同时,由于RUSH3D可以提供足够数据进行分析,跨个体差异可以在一次实验中得到有效缓解。此外,诸如等稀有事件,在RUSH3D的观察中将不再是偶发事件,而是常规可见现象,成百上千倍地提升了活体生物发现的效率。凭借其低光毒性三维观测的优势,该系统还能够同时观察到细胞间的长距离通信,并通过长时间追踪数百万个细胞,揭示集体细胞行为的物理规律和功能涌现的机制,例如能够捕捉从肿瘤发生开始到免疫应答、肿瘤生长的全过程,揭示肿瘤产生的完整免疫活化反应。
作为RUSH3D在医学领域的初探,研究人员首次观测到了急性脑损伤(脑震荡等)后整个大脑皮层范围内的中性粒细胞迁移活动。当小鼠的脑部受到撞击以后,大量的中心粒细胞从血管周边非血管区域流出进入脑实质,也有极罕见的细胞从脑实质回流到血管里,这意味着有些细胞可能通过类淋巴系统进入脑实质,并且会流回血管中将信息传递到生物体的其他地方。通过国际首次捕捉对脑损伤修复过程单细胞水平的免疫反应,有助于开发特定疗法避免急性脑损伤后组织水肿带来的脑功能缺失难题,并为更广泛的脑疾病等医学问题提供新视角。
急性脑损伤后全皮层范围单细胞水平免疫反应(Credit: Cell)
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