Nature Methods：Paired

生命体的正常运转离不开健康的基因组（genome）。基因组就像我们身体的 蓝图 ，指导着细胞的生长、发育和功能。然而，随着时间的推移，各种内源性（endogenous）和环境因素（environmental factors）都会对我们的基因组造成威胁，导致DNA损伤（DNA damage）。想象一下，这份精密的 蓝图 上出现了各种各样的 划痕 和 断裂 ，这无疑会对细胞的正常功能造成影响，甚至可能导致疾病的发生。

长期以来，研究人员一直在努力理解DNA损伤是如何发生的，以及它会对我们的健康产生什么样的影响。然而，由于我们身体内存在着各种各样的细胞类型，而且DNA损伤的发生又具有一定的随机性（stochasticity），想要在复杂的细胞环境中精确地分析DNA损伤及其后果一直是一个巨大的挑战。

3月24日一项发表在《Nature Methods》杂志上的创新研究 Single-cell parallel analysis of DNA damage and transcriptome reveals selective genome vulnerability ，为我们揭开了细胞基因组脆弱性的神秘面纱。研究人员开发了一种名为Paired-Damage-seq的全新技术，能够以前所未有的精度在单个细胞（single cell）水平上同时分析氧化损伤（oxidative damage）和单链DNA损伤（single-stranded DNA damage），并结合分析基因的表达情况（gene expression）。这项突破性的技术，就像给我们的细胞装上了 显微镜 和 录音机 ，让我们能够清晰地看到DNA损伤发生的位置，并同时听到细胞内部基因的 声音 。

为了验证这项技术的强大之处，研究人员首先将其应用在了实验室培养的人类宫颈系（HeLa cells）中，随后又将其应用在了小鼠的大脑（mouse brain）中。通过对这些不同类型的细胞进行深入分析，他们获得了许多令人兴奋的发现，这些发现不仅帮助我们更好地理解了DNA损伤的发生规律，也为我们揭示了细胞类型特异性的基因组脆弱性（selective genome vulnerability）。