年夜豆基因组解析研讨取得停顿 |
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中国迷信院西南地舆与农业生态研讨所研讨员冯献忠课题组等选择1份西南家养年夜豆、7份我国代表性栽培种,联合均匀50×的三代测序和Hi-C测序,组装了高质量年夜豆参考基因组。组装的8个年夜豆基因组年夜小范畴为986.1-1001.3Mb,Contig N50=1.4-6.1Mb,BUSCO完全性评价为96.7%-97.3%;联合同源正文、从头正文、转录组辅助正文,在8个年夜豆中正文获得57286-58392个基因。
基于8个高质量的年夜豆基因组,研讨团队鉴定到186-427万个SNP,44-92万个InDel,11750-25330个年夜的InDel,706-3006个易位变乱,200-413个倒位变乱。在朝生年夜豆中鉴定到60个栽培年夜豆中缺失或变短的基因,以及家养年夜豆种质缺失或变短却在栽培中存在的185个基因。
相关研讨结果以Eight soybean reference genome resources from varying latitudes and agronomic traits为题,颁发在Scientific Data上。该研讨为年夜豆构造变异与育种研讨提供了新的参考基因组。研讨任务获得国度重点研发筹划、中科院重点研讨名目、山东省“泰山学者”名目等的赞助。(100yiyao.com)
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