年夜肠癌的全基因组阐发标明，PHF19和TBC1D16是致癌的超等加强子

转录因子与加强子的联合是转录激活的症结步调之一。近年来，表观的倒退提醒了活性加强子和缄默加强子的新特征，并为多个研讨畛域的转录调控研讨提供了思绪。染色质上的表观标志是细胞辨认的紧张标记，它与转录因子协同调控转录。组卵白修饰标志染色质上的加强子，并对其活性至关紧张。H3K4me1是启动加强子的标志;H3K27ac为活性加强子，H3K27me3为均衡加强子。

尽管最初的发现来自于中介亚基的ChIP-Seq，但当初基因间染色质中的H3K27ac被普遍用于活性加强子的鉴定。此外，研讨发现许多基因通常受多种加强子调控，这些加强子的状态在分歧的细胞类型中也分歧。是以，加强子活性若何调控旌旗灯号通路和选择性基因转录成为许多畛域的症结成绩。

前锋研讨假如加强子活性的得到是癌症的罕见特征之一，比来在患者和植物模子中的一些研讨支持这一点。然而，尚不分明这是一切癌症的独特特征，照样只是此中的一部门。乏味的是，许多与加强子活性的表观调控相关的基因在癌症中常常产生渐变，例如赖氨酸甲基转移酶 2 C/D（KMT2C/D，也称为 MLL3/4）、E1A 联合卵白 p300（EP300）、CREB 联合卵白（ CEBBP)、赖氨酸脱甲基酶 6 A (KDM6A，也称为 UTX) 和赖氨酸脱甲基酶 5 C (KDM5C)。此外，BRD4克制剂(加强子上H3K27ac的一个读卡器)在癌症医治中被证实是无效的。是以，燃眉之急是廓清加强剂在癌症中的作用和潜在机制。

研讨标明，节制症结致癌基因(如MYC原癌基因(MYC))转录的加强子可以区分分歧类型的癌症。能够是因为旌旗灯号网络激活的转录因子在分歧的癌细胞中有很年夜的差别，这就招致了加强子在应答变异基因组渐变和下游旌旗灯号时以分歧的方式被激活。是以，加强子谱图可以反映辨别癌的特征并用于分类。活性加强子的全基因组图谱已在几品种型的癌症中进行，如胰腺癌、鼻咽癌和通明细胞肾癌，通常使用H3K27ac Cheq办法。一项使用TCGA RNA- seq数据的泛癌研讨也阐发了加强子的环球散布，但因为很年夜一部门加强子RNA难以检测，该办法不是很靠得住。

结直肠癌(CRC)是天下上最罕见的癌症之一。近年来对于异常DNA甲基化的研讨曾经在界锋芒毕露，表观调控成为CRC的症结调控因素之一。一些研讨小组曾经研讨了CRC中活性加强子的全基因组散布。晚期研讨以H3K4me1为标志，不得当辨认功效性活性加强子。H3K4me1标志启动加强子，并不代表基因组中的功效性加强子。

比来的一项研讨以正常结肠上皮隐窝、CRC细胞系和四例原发性结肠直肠癌患者为样本，使用H3K27ac ChIP-Seq阐发了活性加强子的全基因组差别。Flebbe等人也在少量直肠癌组织中使用了H3K27ac，但没有阐发癌症特同性加强因子特征。这些研讨使用的临床样本很少，不克不及真实反映结直肠癌组织的临床特征，对增强结直肠癌的研讨没有太年夜帮忙。

研讨CRC患者和人造组织加强因子景观的试验流程。

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在这项任务中，为了树立CRC中活性加强子的全面图谱，作者对73对CRC组织(配对的组织与配对的当地组织)进行了H3K27ac ChIP-seq阐发，并进行了响应的基因组和转录组测序。作者发现了数千种与CRC相关的加强子和多种转录因子，此中一部门已通过试验验证，为CRC的将来研讨提供了紧张的表观基因组资本和研讨候选。（ 100yiyao.com）

参考文献

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