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基于症结基因靶向阐发,确定miR

起源:本站原创 2021-11-19 14:38

MicroRNAs (miRNAs)正在成为一种无效的医治药物。在检测miR-145-5p是否能加重肾脏毁伤时,作者不测发现,正常对照组小鼠细胞外囊泡中负载miR-145-5p可诱导卵白尿和足细胞足突消逝。

MicroRNAs (s)正在成为一种无效的医治药物。在检测miR-145-5p是否能加重肾脏毁伤时,作者不测发现,正常对照组小鼠细胞外囊泡中负载miR-145-5p可诱导卵白尿和足细胞足突消逝。为了探讨miR-145-5p对足细胞的毒性机制,作者假如miR-145-5p可以进入足细胞并克制足细胞必须的基因。作者证实了体系治理的miRNA可以进入足细胞。接上去,作者基于单细胞RNA测序(RNA-seq)预测了611个足细胞必须基因,发现此中32个基因被miR-145-5p预测为靶点。对32个足细胞根本基因的功效正文显示,gtpase介导的小旌旗灯号转导是最次要的路径。

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microrna (mirna)是基因表白的转录后调理剂,其异常表白参加了许多疾病的产生倒退。mirna在肿瘤中广泛下调,影响许多细胞进程,包含细胞周期、增殖、分解和凋亡,从而匆匆进的产生。mirna的失调也参加了非疾病的发病机制。是以,miRNA替代疗法很有前景。例如,let-7被发现削减小鼠肺癌的质量,miR-26a腺相关病毒克制小鼠的产生。

此外,还对其他mirna进行了医治疾病的测试(例如,miR-34a, miR-16, miR-29,和miR-143/miR-145)。医治性microrna通常装载在脂质体、微细胞、胞外或其他中,然落后行体系治理。体系治理和mirna可以达到许多正常组织,包含肾脏。基于mirna的药物终极通过分泌达到肾脏,使肾脏细胞更有能够承受mirna。是以,使用基于mirna的药物医治肾脏疾病是可取的。

miR-145-5p失调已被证实通过介导MALAT1和MEG3对肾脏的影响参加肾毁伤。比来,作者研讨了体系给药miR-145-5p是否可以加重小鼠模子的肾毁伤,出人意料的是,作者发现用细胞外囊泡(ev)装载miR-145-5p医治正常对照组小鼠会招致卵白尿和足细胞足突消逝。在本研讨中,作者研讨了体系治理的miR-145-5p若何惹起足细胞毁伤。

作者推测ev中轮回的miR-145-5p可以进入足细胞,克制足细胞必须的靶基因的表白,招致足细胞毁伤和肾小球滤过屏蔽毁坏。为了证实这一假如,必要确定足细胞的根本基因,然后将其与miR-145-5p的预测靶点进行比拟,以确定哪些足细胞的根本基因被miR-145-5p靶向。

比来,作者设计了一种办法来辨认老鼠足细胞和其他类型细胞所必须的基因。该办法的根本原理是,统一类型的单个细胞在基因表白上存在微小差别,单细胞RNA测序(RNA-seq)研讨标明,相关系数为0.1 ~ 0.5,标明统一类型的单个细胞中年夜多半基因表白存在差别。差别表白的基因是无关紧要的,而在一切单个细胞中广泛表白的基因则对细胞类型至关紧张。依据这一尺度,作者基于小鼠足细胞单细胞RNA-seq数据确定了候选的足细胞必须基因,并通过试验验证了它们对足细胞的需要性,证实了该办法的可行性。足细胞必须基因的可用性使miR-145-5p可否靶向足细胞必须基因并诱导足细胞毁伤成为能够。

基于靶向细胞类型必须基因的miRNA毒性预测办法示用意。

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作者将预测的miR-145-5p靶点与611足细胞必须基因进行比拟,确定了32个miR-145-5p靶点。对预测的32个足细胞必须基因进行基因本体论(GO)阐发,发现小GTPases是受miR-145-5p影响的顶级生物学进程。已知小GTPases的最佳活性对足细胞的生活、构造和功效至关紧张。

作者曾经证明,miR-145-5p改动小的GTPase活性并诱导足细胞毁伤。作者对miR-145- 5p对足细胞毒性机制的解释为懂得miRNA药物反作用的机制以及预测miRNA药物的毒性提供了一种新的办法。( 100yiyao.com)

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