细胞代表:一种新型的lncRNAs可能作为癌症患者新的预后生物标志物和驱动癌症发生的关键基因 |
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来源:原创网站2021-11-23 16:40
2021年11月23日/100医学网bion/-长链非编码RNA(lncRNAs)越来越被认为是癌症的功能单位和强大的生物标志物,但大多数尚未被描述;最近,在国际杂志《细胞报告》上发表了一篇题为“非编码犯罪的泛癌分析揭示了”
2021年11月23日/100医学网bion/-长链非编码RNA(lncRNAs)越来越被认为是癌症的功能单位和强大的生物标志物,但大多数尚未被描述;最近,在国际杂志《细胞报告》(Cell Reports)上发表的一篇题为“非编码转录物的泛癌分析逆转了胶质瘤中的预后肿瘤——LNC核糖核酸hoxa10”的研究报告中,多伦多大学和其他机构的科学家通过分析癌症中的lncRNAs,揭示了一组166个预后生物标志物目录。此外,该目录中的一个生物标志物可以有效地对高风险和低风险胶质瘤(脑癌的一种)进行分类,相关研究结果揭示了lncRNAs作为临床生物标志物和潜在治疗靶点的潜力,相关研究结果可能解释了非编码RNA失衡在癌症发生过程中的关键作用。
图片:Pixabay/CC0公共域
在这份研究报告中,研究人员使用机器学习来分析和评估来自30种不同癌症类型的近9500个样本的5600个样本中的潜在lncRNA生物标志物。最后,他们发现166个lncRNAs与癌症患者的生存直接相关。在临床环境中,这些生物标志物可能潜在地用于增强临床变量、分子特征和癌症亚型在预测患者治疗结果中的价值。
在目录中,研究人员锁定了一个名为HOX10-AS的lncRNA。首先,研究人员利用机器学习分析揭示HOXA10-AS是一个强有力的候选物,可以作为预后生物标志物对高风险和低风险脑癌患者进行分类。为了验证机器学习分析的结果,研究人员在中国上海华山医院开发的新脑癌数据集上进行了相关测试。后来,研究人员转向使用癌细胞、异种移植物和源自患者身体的器官样模型进行功能生物学验证。这些步骤不仅证实了HOXA10-AS可以作为一个强有力的生物标志物,还可能作为一个潜在的治疗靶点,因为它在脑癌的许多重要生物学通路中发挥重要作用,例如HOXA10-AS的过度表达可能与细胞侵袭水平的增加有关,从而降低HOXA10-AS。
图片:https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(21)01340-1?_ return URl=https://linking ub . Elsevier.com/retrieve/pii/s 221124721013401?showall=true
这些生物学实验也为揭示HOXA10-AS的开关样行为提供了证据,并将其与患者的治疗结果相关联。lncRNA表达缺失可能与低危脑肿瘤有关,高表达可能与侵袭性脑肿瘤有关。Reimand研究员表示,我们对这项研究的结果感到非常兴奋,它不仅产生了关于癌症生物学研究的新生物标志物和新思路,也为我们在后期继续深入研究癌症转录组学以帮助治疗患者提供了强大的动力。目前,研究人员才刚刚开始分析核糖核酸在癌症中的作用。随着全转录组测序在临床上变得越来越普遍,越来越多的数据可用,研究人员可能会获得更多有用的研究结果。
癌症基因组的功能注释和识别患者生存的新生物标志物以及调控癌症侵袭性的基因,可能对研究人员进行精准的肿瘤学研究非常重要,即研究人员将根据在肿瘤中发现的遗传变化改进癌症治疗;对驱动癌症发生和发展的关键因素的深刻理解可能会促进研究人员确定新的治疗靶点和治疗策略。这项研究的结果可能会给研究人员带来更多的癌症研究发现,有望在未来更好地改善癌症患者的治疗。总之,这项研究的结果强调了非编码转录组学在识别癌症进展的生物标志物和调节因子方面的潜力。(100yiyao.com 100医疗网)
原始来源:
伊塞夫,蒋凌燕,等,《细胞报告》(2021)。doi :10.1016/j . celrep . 2021.109873
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