癌细胞:探索非小细胞肺癌的潜在生物标志物！

来源：原创网站2021-12-02 13:26

最近，上海中医药大学的一个研究小组对环状核糖核酸进行了研究，以了解其在非小细胞肺癌发生发展中的作用。

2021年12月2日/100医学网BIOON近年来，越来越多的证据表明，circRNA是由前体mRNA反向剪接而成的具有共价环的内源性新RNA，在调控靶基因表达中起着关键作用。cirnas在各种癌症的发病机制中有广泛的报道，提示cirnas可能是更好的生物标志物和治疗靶点。但对与非小细胞肺癌发生发展密切相关的关键环状circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络的认识仍十分有限，新的治疗指标和预后标志物有待进一步探索。

最近，上海中医药大学的一个研究小组对环状核糖核酸进行了研究，以了解其在非小细胞肺癌发生发展中的作用。

在这项研究中，研究人员在两个基因表达综合数据集(GSE101684和GSE112214)中识别了非小细胞肺癌组织和匹配的相邻正常组织之间的差异表达环状rna (DECs)。此外，构建了一个潜在的非小细胞肺癌circRNA-miRNA-mRNA调控轴的ceRNA网络，并通过一系列分析和体外实验验证了该网络的有效性。此外，建立了预后模型，分析了免疫细胞浸润与ceRNA网络的关系。该方法可能揭示非小细胞肺癌发生发展的分子机制，为诊断或预后提供新的潜在生物标志物。

在两个地球同步轨道数据集中，在非小细胞肺癌组织和邻近正常组织之间发现了15个dec。QRT-PCR证实A549和sk-me-1细胞中有7个DECs(HSA _ CIRC _ 0002017，HSA _ CIRC _ 0069244，HSA _ CIRC _ 026337，HSA _ CIRC _ 002346，HSA _ CIRC _ 00733)然后，通过Circinteractome和StarBase筛选出12个circRNA和miRNA，其中hsa-miR-767-3p和hsa-miR-767-5p明显上调通过miRDB和细胞角发现了12个miRNA靶基因。还进行了功能富集、基因组突变和诊断分析。FNBP1、AKT3、HERC1、COL4A1、TOLLIP、ARRB1、FZD4和PIK3R1通过TIMER数据库与免疫浸润相关。根据cox回归和诺模图分析，ARRB1、FNBP1、FZD4和HERC1的表达与非小细胞肺癌患者较低的总生存期(OS)有关。

GSE10684和GSE112214中DECs火山图

总之，基于GEO数据集挖掘、一系列生物信息学分析和体外验证实验，本研究构建了一个潜在的非小细胞肺癌circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络。此外，hub基因的表达与非小细胞肺癌患者的预后和免疫细胞浸润有关。这些发现确定了用于诊断或预后的潜在生物标志物，并为非小细胞肺癌发生和发展的潜在机制提供了新的见解。

来源：杨军，郝若尔，等。癌细胞国际2021年11月20日。21(1):611.doi : 10.1186/s 12935-021-02278-z . PMID : 34801043；PMCID: PMC8605517。

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