科学:中国科学家成功构建了肿瘤浸润性T细胞的泛癌单细胞图谱

来源：原创网站2021-12-23 06:54

在一项新的研究中，为了建立高分辨率的泛癌T细胞图谱，来自中国北京大学的研究人员对各种癌症类型患者的肿瘤、邻近组织和血液样本进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)，并收集了其他已发表的scRNA-seq数据集。在校正混杂因素和批次效应后，这些不同的数据被整合。

2021年12月23日/Bion/-靶向肿瘤特异性T细胞的癌症免疫疗法已使许多癌症患者受益，但不同类型癌症的临床疗效差异很大。肿瘤浸润的T细胞往往会进入功能障碍状态，这种状态被广泛称为T细胞衰竭。效应T细胞的抗肿瘤功能受多种因素调节，包括调节性T细胞(Treg细胞)的存在。不同癌症类型的微环境(TME)中T细胞的状态和丰度是不同的，这可能从根本上影响不同的临床参数，例如对免疫疗法的药物反应。

在一项新的研究中，为了建立高分辨率的泛癌T细胞图谱，来自中国北京大学的研究人员对各种癌症类型的患者、邻近组织和血液样本进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)，并收集了其他已发表的scRNA-seq数据集。在校正混杂因素和批次效应后，这些不同的数据被整合。该图谱由21种癌症类型的316名患者的scRNA-seq数据组成。T细胞表面的T细胞受体(TCR)序列与基因表达谱相结合来描述T细胞的扩增和动态。各种计算方法被用来研究不同癌症类型的T细胞的特征和丰度。相关研究成果于2021年12月17日发表在《科学》杂志上，标题为“影响肿瘤的t细胞的泛癌单细胞景观”。

这些作者在癌症患者中发现了多种潜在的肿瘤反应性T细胞群体。在不同类型癌症的微环境中，pTRT的状态差异很大。对于CD8 T细胞，主要的pTRT是一种高度异质性的失败T细胞。他们通过计算得出，T细胞衰竭的发展路径主要有两种，即效应记忆T细胞和组织驻留记忆T细胞，这两种路径在不同的癌症类型中都很常见。他们还注意到末端耗竭的T细胞与自然杀伤(NK)样T细胞、17型CD8 T细胞(Tc17细胞)和CD8 Treg细胞等之间的状态转换。但这种转变往往发生在特定的癌症类型中。

人类胰腺癌T细胞图谱的系统分析。图片来自science，2021，doi :10.1126/science . Abe 6474。

对于CD4 T细胞，TFH/TH1双功能T细胞似乎起源于TFH细胞，这也是一个值得注意的pTRT，与肿瘤突变负荷有关。他们还发现肿瘤微环境中的TGF-和干扰素可以影响pTRT的转录过程。不同类型的癌症，T细胞状态的丰富程度差异很大。基于浸润性T细胞的组成，可将癌症患者免疫增强为一组高频率的终末衰竭CD8 T细胞和另一组高频率的组织驻留记忆CD8 T细胞，免疫类型与患者的生存率、对免疫检查点阻断的反应等临床特征有关。

综上所述，这些作者描述了肿瘤微环境中T细胞的异质性和动态泛癌景观，并为未来与癌症治疗相关的时间或空间研究建立了基线参考。不同癌症类型的系统比较揭示了不同肿瘤微环境中T细胞状态的共性和差异。它们对浸润性T细胞的详细特征、动力学和调控的揭示将促进免疫治疗的发展，其免疫表型可有助于靶向T细胞的治疗和策略。(100yiyao.com 100医疗网)

参考文献：

郑等。Science，2021，doi :10.1126/science . Abe 6474。

版权声明

本网站标注“来源：百医网”或“来源：bioon”的文字、图片、音视频资料均属于百医网网站版权所有。未经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，否则将承担责任。获得书面授权转载时，必须注明“来源：百医网”。其他来源的文章均为转载。本网站所有转载都是为了传递更多信息。转载不代表本网站的立场。不想被转载的媒体或个人可以联系我们，我们会立即删除。

87%的用户在随时阅读、评论、分享百医网APP。请扫描二维码下载-