“德尔塔克隆”是德尔塔和奥米克隆的混合体 它的起源是个谜 |
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来源:生物勘探2022-01-14 08:35
Kostrikis指出,Deltacron结合了Delta和Omicron的基因,可能来自同时感染Delta和Omicron的患者。在这项研究中,从塞浦路斯收集了25个突变样本,其中11个样本来自新冠肺炎的住院患者,14个样本来自普通感染者。相比之下,住院患者样本的突变频率更高,这可能意味着Deltacron与住院之间存在相关性,因此
Kostrikis指出,Deltacron结合了Delta和Omicron的基因,可能来自同时感染Delta和Omicron的患者。在这项研究中,从塞浦路斯收集了25个突变样本,其中11个样本来自新冠肺炎的住院患者,14个样本来自普通感染者。相比之下,住院患者样本的突变频率更高,这可能意味着Deltacron与住院之间存在相关性,因此需要关注Deltacron的致病性和传染性。此外,德尔塔克朗的研究数据已提交给地理信息系统援助全球数据库。
新冠肺炎重组变异体的出现引起了广泛关注,一些专家讨论了这种变异体的真实性。蒙特利尔麦吉尔大学健康中心研究所的科学家FatimaTokhmafshan在推特上说,这种病毒不是重组的,而是实验室污染造成的。通过查看塞浦路斯最近提交的GISAID聚类和突变谱,没有发现突变共识。世卫组织Covid专家Krutika Kuppalli博士对此表示赞同。她在推特上表示,在Delta样本中检测到的Omicron成分可能是由于实验室中样本污染导致的测序伪影,而不是新的重组病毒的出现。与此同时,伦敦帝国理工学院病毒学家汤姆皮科克博士也在推特上表示,媒体报道的Deltacron序列显然是样本污染造成的。其他专家也看到了Deltacron的序列信息,我们得出了一致的结论:Deltacron看起来不像是真正的病毒重组,更像是样本污染的结果;另一位知名科学家、亚特兰大埃默里大学传染病专家博古马卡比森蒂坦吉博士对此持谨慎态度,并于周日在推特上表示,关于deltacron的结论仍需谨慎,而现有信息指向样本的污染,而非Delta和omicron的真正重组。
在此之前,已经有关于新冠肺炎基因重组的报道。2021年10月11日在Medrxiv发表的题为“严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(新型冠状病毒)和变异体之间的基因组重组”的文章报道了在日本发现的和重组变异体。Nexstrain对这一发现数据的系统发育树分析证实重组病毒序列可以在同一簇中找到。但通过对Deltacron数据的同样分析,发现它几乎分布在每个分支,不存在日本发现的重组病毒的集群分布特征。
此外,其他Delta分支中带有Omicron的完整ARTICLE引物对扩增子进行了测序,这是由于ARTICLE引物方案中扩增子72的失败造成的,因为这些序列中的所有Omicron突变(即A67V、H69_V70del、T95I、G142D、V143_Y145del)都在这个扩增子中,但来自其他样品的低水平污染物填补了这一空白,所以(100yiyao.com)
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