自然:揭示奥密克戎的遗传特征和早期传播方式

来源：原创网站2022-01-31 23:59

在一项新的研究中，一个大型国际研究小组发现，新型冠状病毒的奥密克戎变异体和新型冠状病毒的前一个变异体之间的差异是适应性进化的结果，在适应性进化中，有益的突变通过自然选择而不是前一个变异体之间的重组传递给后代。

2022年1月31日/Bion/-在一项新的研究中，一个大型国际研究团队发现，新型冠状病毒的奥密克戎变异体和新型冠状病毒的前一个变异体之间的差异是适应性进化的结果，在适应性进化中，有益的突变通过自然选择而不是前一个变异体之间的重组传递给后代。本研究首次描述了Omicron变异体的基因组特征，并探索了该变异体的起源。相关研究成果于2022年1月7日在线发表在《自然》杂志上，标题为“新型冠状病毒人口变异在南部非洲的快速疫情扩张”。

该论文的合著者、宾夕法尼亚州立大学生物学副教授Maciej Boni说，“我们已经看到，新型冠状病毒在大约16个月的时间里产生了三种主要的变种——Alpha、Delta和Omicron，这非常令人惊讶，因为其他病毒不会进行如此反复的大规模进化跳跃。最新的变体——Omicron——是不寻常的，因为它在刺突蛋白的进化上有了更大的飞跃。”

图片来自Pixabay/CC0公共领域。

Boni指出，与以前的变体相比，Omicron变体的刺突蛋白有30多个突变，其中许多已知会影响宿主抗体的中和作用。他说，“鉴于Omicron变体在进化上取得了如此巨大的飞跃，我们想研究这是为什么以及如何发生的。”

为此，该团队分析了截至2021年12月7日的所有686个Omicron序列。他们发现Omicron属于B.1.1谱系，Alpha变体也属于这个谱系。有趣的是，研究小组发现奥米克隆变异体在遗传上不同于阿尔法变异体和任何其他已知的感兴趣的变异体。

博尼说，“这意味着，虽然奥米克隆变异体与阿尔法变异体属于同一谱系，但它发生了如此大的变化，以至于在很大程度上无法被识别为阿尔法变异体的表亲或侄子。当首次对奥米克龙的基因组进行测序时，很明显，这种病毒可能与我们以前熟悉的新型冠状病毒变种非常不同。”

为了确定奥米克隆变体首次出现的时间，该团队使用了一种称为时间校准贝叶斯生理分析的技术。他们估计，2021年10月初，所有Omicron变异体最接近的共同祖先已经存在。

接下来，该团队分析了686个Omicron序列的选择，并发现了许多基因被自然选择积极选择的证据，因为这种变体偏离了其他B.1.1谱系。博尼说，“这一发现使我们得出结论，适应性进化在奥米克隆的早期出现和建立中发挥了重要作用。这一发现表明，Omicron可能是一个进化过程的结果，该过程产生了一种高度传播的病毒，该病毒部分逃脱了我们的抗体反应。”

此外，这一发现排除了奥米克龙变异体的起源是先前变异体重组的结果。博尼说，“我们没有发现令人信服的证据表明奥米克龙变异体是先前新型冠状病毒变异体的重组。”

研究小组确实发现，Omicron的一些样本显示了从Delta变体中继承物质的微弱证据，但统计分析不能排除随机因素或小的测序错误是这种奇怪重组信号的原因。

Boni说，“鉴于最近的错误信息，即Omicron和Delta变体已经重组，产生了一个名为‘Delta cron’的超级变体，需要注意的是，这种重组实际上是可能的，但目前没有证据表明这种情况已经发生。”此外，如果真的发生了，我不知道这种病毒在传播能力和/或引起严重疾病等因素方面的特征。"

关于奥米克隆变异体的传播性，研究小组的结论是，鉴于南非人口的免疫接种率(无论是来自感染、疫苗接种还是两者)都在60%以上，部分免疫逃避可能是奥米克隆在南非快速传播的主要驱动因素。

博尼说，“奥米克隆可以部分逃脱免疫系统的想法得到了最近其他研究结果的支持，这些研究结果表明，与奥米克隆的出现相关的新型冠状病毒再感染风险增加。现在我们也知道，Omicron的病毒载量在感染者中相对较高，这也在很大程度上促成了它的高传播率。”

博尼指出，目前的奥米克隆疫情提醒所有美国人尽可能保持我们的新冠肺炎疫苗接种。他说，“我们不能再忍受50万人死亡的一年了。”(100yiyao.com 100医疗网)

参考文献：

Raquel Viana等人。Nature，2022，doi :10.1038/s 14586-022-04411-y。

版权声明

本网站标注“来源：百医网”或“来源：bioon”的文字、图片、音视频资料均属于百医网网站版权所有。未经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，否则将承担责任。获得书面授权转载时，必须注明“来源：百医网”。其他来源的文章均为转载。本网站所有转载都是为了传递更多信息。转载不代表本网站的立场。不想被转载的媒体或个人可以联系我们，我们会立即删除。

87%的用户在随时阅读、评论、分享百医网APP。请扫描二维码下载-