乳腺癌临床样本的蛋白质组学揭示潜在的生物标志物和治疗靶点

来源：原网站2022-03-07 16:05

近年来，乳腺癌的基因组分类取得进展，显著提高了乳腺癌的诊断水平，进一步改善了患者的预后。然而，基于蛋白质表达谱的新分类被提出，它可以更可靠地揭示支持乳腺癌异质性的功能表型差异，是目前临床试验和治疗决策的主要手段。

近年来，乳腺癌的基因组分类取得进展，显著提高了乳腺癌的诊断水平，进一步改善了患者的预后。然而，基于蛋白质表达谱的新分类被提出，它可以更可靠地揭示支持乳腺癌异质性的功能表型差异，是目前临床试验和治疗决策的主要手段。

最近，发表在《国家通讯》上的一篇题为“乳腺癌临床标本档案的蛋白质组学分析识别具有不同生存结果的生物亚型”的文章使用了鸡蛋。白色蛋白质组分析描述了临床上可应用的乳腺癌的异质性，识别了潜在的生物标志物和治疗靶点，为临床乳腺癌分类提供了理论支持。

在这项研究中，研究人员使用了一种基于MS分析的高灵敏度蛋白质组学方法，称为单壶，即固相增强样品制备-临床组织蛋白质组学(SP3-CTP)，它可以捕捉福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样品的生物学特征。通过使用这种方法，可以查询与结果数据相关的大量FFPE材料样品，从而可以采用高效的工作流程，从低输入量的通常可获得的患者样品中充分和定量地表达蛋白质。

研究人员对FFPE乳腺癌的300例手术标本(每种PAM50亚型75例)进行了全面的蛋白质组学分析，这些标本来自2008-2013年(n=178)和1986-1992年(n=122)诊断的具有相关临床结果的患者。分别对两组数据进行分析，对全部300个样本中的4214个蛋白质进行了定量。蛋白质组学的结果与详细的临床结果、基于IHC和PAM50 RNA的内在亚型相关。结果显示，在以PAM50分类的侵袭性基础病例中，蛋白质组分析显示两组中的一组具有特征性免疫发热表达特征和高度有利的存活率。根据细胞外基质、脂质代谢和免疫反应的特征，将Her2富集的病例分为异质组。此外，研究人员分析了蛋白质组中88例三阴性乳腺癌(TNBC)的异质性。结果显示，88例TNBC中，TNBC23的4个亚型具有基础免疫热、基础免疫冷、间充质和腔内的特点，存活结果不同。

图08-13乳腺癌不同蛋白质组的主要特征

该研究为现有的化疗或新兴的免疫治疗提供了潜在的生物标志物，具有重要的临床意义。(100yiyao.com 100医疗网)

参考文献：Asleh，k .Negri，G.L .斯潘塞米科，S.E .等。档案乳腺癌临床标本的蛋白质组学分析确定了具有不同生存结果的生物学亚型。全国社区13，896 (2022年)。https://

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