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自然遗传学:科学家揭示人类基因调控元件的序列决定因素

来源:科技部生物中心2022年3月17日12:49

DNA可以决定基因表达的位置和时间,但控制基因表达的完整序列决定簇仍不清楚。近日,芬兰赫尔辛基大学的研究团队在《Nature Genetics》发表了一篇题为《人类基因调控元件的序列决定因素》的文章。研究人员使用大规模并行报告实验来测量比人类基因组大100倍的基因

DNA可以决定基因表达的位置和时间,但控制基因表达的完整序列决定簇仍不清楚。近日,芬兰赫尔辛基大学的研究团队在《Nature Genetics》发表了一篇题为《人类基因调控元件的序列决定因素》的文章。

研究人员使用大规模并行报告实验来测量比人类基因组大100倍的DNA序列的转录活性。机器学习模型表明,转录因子(TF)通常以弱语法的加性方式起作用,大多数增强子通过不涉及特定TF-TF相互作用的机制增加启动子的表达。增强子本身可分为三种类型:经典型、封闭染色质型和染色质依赖型。结果表明,在一个细胞中很少有TF具有很强的活性,而在不同的细胞类型中,大多数TF的活性是相似的。单个TF可以具有多种基因调控活性,包括染色质的打开和加强,促进和决定转录起点的活性。

上述结果与TF结合基序是基因表达的关键原子单位的观点一致。(100yiyao.com)

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