科学:揭示某些中和抗体仍能有效中和包括奥密克戎在内的新冠肺炎变种

来源：100医疗网原创2022-04-24 17:22

作为新型冠状病毒有趣的变种，b . 1 . 1 . 529奥密克戎奥米克隆)的出现和迅速传播引起了人们的警惕。特别麻烦的是Omicron受体结合结构域(RBD)中的15个氨基酸取代，因为靶向

作为新型冠状病毒有趣的变种，b . 1 . 1 . 529奥密克戎奥米克隆)的出现和迅速传播引起了人们的警惕。特别麻烦的是Omicron受体结合结构域(RBD)中15个氨基酸的替换，因为靶向RBD的抗体(即靶向RBD的抗体)是发现的唯一对其它变体保持足够效力的抗体。为了确定能够有效中和Omicron的抗体，美国国家过敏和传染病研究所的研究人员在一项新的研究中评估了RBD靶向抗体结合和中和Omicron的能力，并通过功能测试和cryo-EM结构确定了它们的识别模式。相关研究成果发表在2022年4月22日的《科学》杂志上，题目是包括B.1.1.529在内的新型冠状病毒变体的波特恩体中和的结构基础

有趣的Omicron变体对大多数单克隆抗体和接种者和康复者的血清的中和具有很大的抗性。鉴定对这种变异体保持中和作用的单克隆抗体，并了解它们识别的结构机制，将有助于开发保持其有效性的疫苗和抗体疗法。

融合前构象的Omicron刺突蛋白低温电镜结构显示单一RBD向上构象，RBD取代突变位于刺突蛋白的外表面。尽管有这种定位，RBD取代突变直接位于或邻近所有以前鉴定的RBD靶向中和抗体的表位。这项新的研究表明，抗体A23-58.1，B1-182.1，COV2-2196，S2E12，A19-46.1，S309和LY-CoV1404仍然保持了对这种新变体的大量中和作用。为了提供结构和功能解释，这些作者确定了抗体-刺突蛋白复合物的低温电子显微镜结构，并使用代表15种RBD氨基酸取代中每一种的病毒颗粒来描述其功能效应。

Omicron刺突蛋白的低温电子显微结构。(A)说明刺突蛋白的结构域排列的示意图。Omicron变体的棘蛋白中的突变是显著的。RBM是受体结合模式的缩写。(B)分辨率为2.79埃B)6微米刺突蛋白的低温电子显微照片。原体以不同的紫色调表现。(Omicron刺突蛋白的低温电子显微结构，表明原生动物中模式突变的位置。(D)六角刺突蛋白RBD显示在两个正交方向上，突变氨基酸残基的C位置显示为红色球体。图片来自Science，2022，doi :10.1126/Science . ABN 7760。

对于与受体ACE2竞争的I类和II类抗体，例如来自VH1-58的抗体B1-182.1和S2E12，这些分析表明有效的中和需要较小的抗体侧链来适应S477N突变。对于其他抗体，如LY-CoV555和A19-46.1，这些抗体的表位在几个RBD氨基酸附近被取代。E484A或Q493R大大降低了LY-CoV555的结合，然而，对于A19-46.1，这些取代通常是可容忍的。A19-46.1和刺突蛋白的低温电镜结构显示RBD的两个向上构象，A19-46.1只与RBD的向上构象结合。对于结合在ACE2结合表面之外的III类和IV类抗体，如A19-61.1、COV2-2130、S309和LY-CoV1404，单个RBD氨基酸取代通常是可容许的。

单克隆抗体及其组合有效中和B.1.1.529 Image from Science，2022，doi :10.1126/Science . ABN 8897的结构基础。

但A19-61.1的中和作用被G446S消除；COV2-2130显示对Omicron的中和作用大大降低，但没有一个突变显示出实质性影响。S309保留了其对奥米克隆的效力，尽管其对奥米克隆的BA.2亚型几乎没有效力(半最大抑制浓度降低至1374 ng/ml)；LY-CoV1404保留了有效的中和作用(5

最后，这些作者评估了单克隆抗体的组合，发现几种组合，包括B1-182.1和A19-46.1的组合，显示了中和的协同作用。Omicron spike蛋白与B1-182.1和A19-46.1的三元复合物的结构表明，B1-182.1诱导优先向上的RBD结合构象，促进A19-46.1的协同结合，这是它们协同作用的基础。

总之，尽管Omicron突变聚集在一起，但它们几乎影响所有已知的RBD靶向中和抗体。这项新研究揭示了选定的RBD导向抗体(如S2E12和LY-CoV1404)的结构基础，以保持对奥米克隆的有效中和。这些作者进一步确定了可用于治疗的抗体组合，并证实了这些组合如何克服大范围的刺突蛋白突变。(100yiyao.com)

参考资料：

周同庆等。科学，2022，doi :10.1126/science . ABN 8897。

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