《分子癌症》：准确率超95%!中国医学科学院肿瘤医院团队提出基于血液cfDNA甲基化特征的肠癌无创筛查法

《分子癌症》：准确率超95%！中国医学科学院肿瘤医院团队提出基于血液cfDNA甲基化特征的肠癌无创筛查法

来源：奇点糕 2023-10-15 15:19

ColonSecure不仅能准确识别已发展到肠癌的患者，还能准确区分良性腺瘤与肠癌，以避免过度诊治：在1735例存在良性腺瘤的高危人群中，ColonSecure识别1556例为阴性，识别特异性达到89

近日，中国医学科学院医院高亦博、刘骞团队在Molecular Cancer期刊发表的最新研究成果正与此相关：研究者们开发了可无创检测血液内游离DNA（cfDNA）甲基化特征的创新工具 ColonSecure，包含149个超甲基化特征，以用于对肠癌高危人群的 滴血验癌 ，并在前瞻性研究中进行验证。

对近3500名肠癌高危人群开展的验证性研究结果显示，ColonSecure可以识别103例经肠镜确诊肠癌患者中的89例，检测敏感性达到86.4%，远超癌胚抗原（CEA）等传统肿瘤标志物检测的水平，准确度（以受试者工作特征曲线下面积，即AUROC评价）也达到95%以上，展现了非常高的应用潜力[1]。

论文首页截图

此前在美国获批、基于粪便样本的肠癌试剂盒，实际上检测的就是特定基因位点甲基化水平[2]，因此本次中国医学科学院肿瘤医院团队的研究，可以说是 转化+完善 ，一方面沿用此前的成功思路，另一方面则是继续优化检测准确度，毕竟基于单一位点或几个位点的检测，敏感性表现还不够理想。

为构建更的检测Panel，研究团队首先分析了癌症基因组图谱计划（TCGA）等数据库资料，专门筛选肠癌特异性的甲基化位点（绝对甲基化差异 0.2，AUROC 0.9），并在71例肠癌患者和74例健康人组成的探索队列中初步验证。

初步验证把潜在的可用甲基化位点从19.3万个缩小至1.2万个，接下来研究团队又对196例患者和200名普通人（分为训练队列/验证队列）血样进行深度测序，最终圈定了149个用于ColonSecure筛查工具的超甲基化特征。

而为评估ColonSecure的实战表现如何，研究团队从北京、广州和河北三地的11.4万余名报名城市居民中，筛选出了3493例符合要求的肠癌高危人群（高危人群标准为有肠癌病史或家族史、患炎症性肠病、有排便习惯改变或粪便异常等，且入组人群需同意接受肠镜检查），作为前瞻性筛查队列的研究对象。

研究整体流程图

在这些肠癌高危人群中，有103人在提供血样检测cfDNA甲基化水平后的三个月内，经肠镜检查确诊为肠癌，而ColonSecure成功识别出了其中的89例，包括34例早期患者（I/II期），整体的AUROC达到0.956，特异性和敏感性则分别为90.7%和86.4%，而传统肿瘤标志物的检测敏感性仅为25.2-45.6%。

ColonSecure检测能力与传统标志物的对比

ColonSecure不仅能准确识别已发展到肠癌的患者，还能准确区分良性腺瘤与肠癌，以避免过度诊治：在1735例存在良性腺瘤的高危人群中，ColonSecure识别1556例为阴性，识别特异性达到89.7%。

参考文献：

[1]Zhao F, Bai P, Xu J, et al. Efficacy of cell-free DNA methylation-based blood test for colorectal cancer screening in high-risk population: a prospective cohort study[J]. Molecular Cancer, 2023, 22: 157.

[2]Imperiale T F, Ransohoff D F, Itzkowitz S H, et al. Multitarget stool DNA testing for colorectal-cancer screening[J]. New England Journal of Medicine, 2014, 370(14): 1287-1297.

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