Cell：傅天民团队报道DdmDE系统清除质粒的分子机制

基因平行转移（Horizontal Gene Transfer,HGT）是个体之间进行遗传物质交换的重要过程。遗传物质的交换和重组推动着生物体适应多变的自然环境，同时也带来了严重的风险。细菌中，质粒是基因平行转移的重要载体，有可能破坏细菌基因组的稳定性和完整性。为了应对这些风险，细菌演化出了多种质粒防御系统，例如SPARTA系统。2023年7月，傅天民团队曾在Nature上发文报道SPARTA的组装与激活机制。

DdmDE是一类最新发现的质粒防御系统。2022年，瑞士洛桑联邦理工学院的Blokesch课题组在霍乱弧菌中发现DdmDE系统。该系统由两个蛋白质组成：DdmD和DdmE。序列分析发现DdmD包含超家族II（SF2）解旋酶结构域和一个PD-(D/E)XK核酸内切酶结构域的蛋白质。DdmE是一种类Argonaute蛋白，含有MID结构域和PIWI-like结构域。体内遗传学研究表明DdmD和DdmE协作抵抗质粒侵袭，善于清除长度较短、多拷贝质粒（ 10kb）。

2024年8月21日，美国俄亥俄州立大学医学院的傅天民研究团队，在Cell杂志上发表了题为DdmDE eliminates plasmid invasion by DNA-guided DNA targeting的研究论文，报道了DdmDE介导的质粒清除的分子机制。