Nat Genet:X染色体遗传多样性揭秘:克隆竞争塑造多样性景观 |
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X染色体失活(X chromosome inactivation,XCI)是指两条X染色体中有一条随机失去活性,导致该染色体上大多数基因沉默,以实现XX雌性个体和XY雄性个体间X染色体上基因表达处于同一水平,这个现象在真兽类哺乳动物例如人类和小鼠中普遍存在(图1)。
XX个体是克隆异质的,人类X染色体上蛋白质编码基因总共包含约40万个非同义SNP,这些SNP改变了它们的编码潜力,使得人类X染色体存在广泛的变异,产生克隆多样性,从而导致两组克隆在X染色体上存在相互排斥的序列变异。这种XX个体普遍存在的X连锁多样性对生物发育的潜在意义是什么?这些克隆是否存在相互作用?还有待进一步发掘。
近日,来自英国伦敦帝国理工学院的Matthias Merkenschlager研究小组在Nature Genetics杂志上发表题为Competition shapes the landscape of X-chromosome-linked genetic diversity的研究论文,这篇文章深入研究了人类STAG2基因中的X连锁编码变异,这种变异模式不同于随机变异,作者发现在存在XCI沉默变异等位基因的竞争克隆下,表达STAG2variant的小鼠模型中不能形成淋巴细胞,其原因和Stag2的野生型竞争者Stag2wt的克隆竞争有关,当STAG2variant克隆面临Stag2wt克隆的竞争时,其淋巴样命运选择受到抑制;而一旦去除Stag2wt克隆的竞争,STAG2variant克隆则能全面恢复它的细胞命运选择能力,表明表观遗传多样性克隆之间的相互作用可以在XX个体中发挥作用,揭示了X连锁遗传多样性在XX个体细胞命运选择中的独特作用机制。
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