Cell重磅：付巧妹团队通过牙结石古DNA证实，哈尔滨古人类“龙人”并非全新人类，而是丹尼索瓦人

Cell重磅：付巧妹团队通过牙结石古DNA证实，哈尔滨古人类“龙人”并非全新人类，而是丹尼索瓦人

来源：生物世界 2025-06-19 10:09

最新的古 DNA 研究为哈尔滨古人类个体的群体归属和丹尼索瓦人群的较完整形态提供了关键线索。

1933 年，哈尔滨的一位建筑工人发现了一枚古人类头骨化石，他意识到头骨的不同寻常，没有将其交给彼时占据东北的日本侵略者。而是将头骨带回家，藏匿在一口废弃的井里，直至临终他才向家人吐露这个秘密。2018 年，这枚保存完整的头骨化石重见天日，发现者的家人将其捐赠到了河北地质大学地球科学博物馆。

这个头骨化石是迄今为止发现的最完整的古人类化石之一，也是已知的最大的人属头骨化石，铀系测年认定其不晚于14.6万年。

2021 年 6 月，河北地质大学、中国科学院古脊椎动物与古人类研究所的研究人员在The Innovation期刊连发 3 篇论文，认为这枚头骨代表了一个全新的古人类支系，并将其命名为： 龙人 （Homo longi）。

然而，学术界对于将龙人确定为一个全新的古人类支系存在争议，形态学研究揭示，其与青藏高原白石崖溶洞的丹尼索瓦人下颌骨存在显著相似性，因此，一些古人类学着认为，龙人可能属于丹尼索瓦人，但这一观点缺乏直接的古 DNA 或古蛋白证据。

丹尼索瓦人是一支基于遗传学信息发现的神秘的已灭绝古人类群体，现有古DNA和古蛋白证据将来源于丹尼索瓦洞穴、青藏高原白石崖溶洞以及台湾澎湖海域等遗址点出土的牙齿、骨骼碎片及不完整下颌骨归属于丹尼索瓦人群，暗示他们可能曾广泛分布在亚洲地区。

然而，目前的丹尼索瓦遗骸都较为残破，缺乏较完整的形态特征，难以解析其与亚洲其他古人类群体之间的演化关系。解决这一问题的关键，在于获取同时具有完整形态和遗传学上确凿的群体归属的化石，而 龙人 头骨化石有希望提供这一突破性的证据。

而最新的古DNA研究为哈尔滨古人类个体的群体归属和丹尼索瓦人群的较完整形态提供了关键线索。

2025 年 6 月 18 日，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所付巧妹团队与河北地质大学季强团队及古 DNA 技术先驱、2022 年诺贝尔生理学或医学奖得主Svante P bo教授合作，在国际顶尖学术期刊Cell发表了题为：Denisovan mitochondrial DNA from dental calculus of the 146,000-year-old Harbin cranium的研究论文，该研究通过古 DNA 技术为 龙人 的群体归属以及丹尼索瓦人的较完整形态提供了关键线索。

该研究通过优化实验提取方案和研发生信分析方法的创新，首次成功从 龙人 头骨的牙结石中获取到古老型人类古DNA。这是自丹尼索瓦人发现15年以来，首次用遗传学证据将较完整的头骨形态与丹尼索瓦人关联起来，为丹尼索瓦人的研究提供了关键线索，加深了我们对东亚古人类多样性及其演化历史的理解。同时，从牙结石中成功提取宿主古DNA更为中更新世人类遗传学研究开创了新途径。

来自近乎完整头骨牙结石中的丹尼索瓦人线粒体DNA研究总结图

目前，全球仅有4个10万年以上的古人类遗址成功获取到人骨古DNA数据，可见从哈尔滨古人类（龙人）化石样本中获取古DNA面临着严峻的技术挑战。在明确其牙齿和颞骨无古DNA的情况下，研究团队另辟蹊径，从牙结石中获得中更新世的古DNA。牙结石特殊的矿化结构，会在形成过程把宿主细胞、口腔微生物等包埋其中，相对封闭。

研究对两份微量牙结石样本（0.5mg和0.3mg）进行提取实验优化，将可能存在的提取液以及实验过程的残留物（硅胶膜和沉淀物）进行多方案提取，构建了20个DNA文库，从中筛选出7个含丹尼索瓦人特异性变异的文库（均来自0.3mg样本）用于下游分析。

通过自主开发的污染评估方法，识别出高达82%的现代人污染，后续分析仅严格选用具有古DNA降解特征的短片段数据（ 60 bp）。同时，研究团队自主开发的算法构建了人类祖先型和丹尼索瓦人祖先型参考序列，以最大程度减小比对误差和筛选出较准确的古DNA片段。

通过获取的宿主线粒体DNA分析显示，哈尔滨古人类个体属于丹尼索瓦人分支，研发生信分析方法确定不同支系的关键位点，明确了其与西伯利亚丹尼索瓦洞穴早期个体更相关，而与晚期个体不同。结合这些个体的年代信息，丹尼索瓦洞穴早期个体的年代范围分别是18.7 万-21.7万年，12.3 万-19.4万年和约19万年前，晚期个体年代大约为5.2 万-8.4万年，而哈尔滨古人类个体的年代不晚于14.6万年，与早期丹尼索瓦人的年代更接近。

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