Nature:生命的“数字孪生”?Giotto Suite如何绘制跨越尺度与模态的终极组织地图 |
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如果我们不再将生命组织视为一锅由无数细胞熬成的 浓汤 ,而是能够像欣赏一幅超高分辨率的《清明上河图》一样,清晰地看到每一个 细胞居民 的精确位置、它们的身份、它们在和邻居 聊 些什么,甚至能窥探它们 房间 内部的陈设。这并非科幻,而是 空间组学 (Spatial Omics) 时代为我们展开的壮丽画卷。
这项革命性的技术让我们能够在组织的原位背景下,以前所未有的精度解码生命的分子语言。然而,这场技术革命也带来了一场 数据海啸 。不同的空间组学技术就像来自世界各地的测绘队,它们使用着不同的语言(数据模态)、不同的比例尺(分辨率)、绘制出风格迥异的局部地图。如何将这些碎片化的、多模态、多尺度的数据整合,拼凑出一张完整、连贯且蕴含深刻生物学意义的生命地图?这已成为当今生命科学领域最严峻的挑战之一。
10月1日,《Nature Methods》的研究报道 Giotto Suite: a multiscale and technology-agnostic spatial multiomics analysis ecosystem ,为我们带来了一个强大而优雅的解决方案。它不像一位孤独的探险家,而是像一位运筹帷幄的 地图总规划师 ,提供了一整套名为Giotto Suite的分析生态系统,旨在统一混乱的数据语言,连接孤立的信息岛屿,让我们能够真正读懂组织这部复杂而立体的 天书 。
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