Plant Physiology:研讨提醒番茄产量性状遗传和驯化根底 |
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近日,华中农业年夜学园艺动物生物学教育部重点试验室叶志彪传授团队通过全基因组联系关系阐发(GWAS)对27个株型相关产量性状进行了体系的高通量遗传解析,提醒了番茄株型相关产量性状的根底,为番茄高产育种奠基了紧张实际根底。相关研讨以“Genome-wide association study reveals the genetic architecture of 27 agronomic traits in tomato”为题,在线颁发于Plant Physiology。
番茄是天下第一年夜莳植和消费蔬菜,也是我国第一年夜举措措施蔬菜。近20年来,我国番茄莳植面积趋于稳定,然则产量照样稳步提升,这次要是得益于番茄高产新种类和栽培新技术的普遍推行和利用。今朝,与产量间接相关的性状(要是实年夜小)曾经获得了很好的研讨,共有30多个果实年夜小QTL被鉴定。然而,其他与产量相关的性状,如花序地位、花序构造和叶片气孔密度等,也对番茄的产量至关紧张。是以,相识这些产量相关性状的构造可认为高产育种提供信息。
本研讨起首搜集了66份来自广西东北部山区的番茄处所种类,并对其进行了重测序。这些处所种类果实小而红,皮薄,具备名贵的品质和抗性遗传资本。群体遗传学阐发显示广西番茄和樱桃番茄(S. lycopersicum var. Cerasiforme,CER)聚类到一路,正好将南美樱桃番茄与非南美樱桃番茄离隔。这个成果阐明我国广西番茄种质是番茄在朝蛮人茄在南美经驯化后引入到我国,再颠末自力驯化而获得的新亚组,在基因组程度上有其特同性。应用该重测序数据,联合之前已报道的539份番茄种质的重测序数据,构建了改进的番茄单倍型图谱,为番茄研讨和育种提供了有代价的资本。对605份(66+539)番茄资本共27个产量相关性状进行表型阐发发现,这27个农艺性状之间具备较强的表型相关性。应用高分辩率单倍型图谱,咱们对这27特性状进行了GWAS,共鉴定到了129个QTL位点。进一步对这129个联系关系显着位点与番茄驯化改进进程中的受选择位点进行比拟发现,在番茄育种进程中,特殊是改进进程中,共有25个产量相关性状对应的51个旌旗灯号位点遭到人工选择。本研讨为番茄驯化改进进程中产量相关性状的驯化提供了根底,
对候选位点阐发发现,除了一些功效已知的调控基因之外,咱们还发现了好多可托度高的候选基因。例如,叶片气孔密度的GWAS定位到一个编码铝活化苹果酸转运体的候选基因SlALMT15。应用CRISPR/cas9技术敲除SlALMT15不仅证明了其在气孔造成中的作用,并且提醒了其在番茄干旱钳制耐受中的紧张作用。(100yiyao.com)
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