Genome Medicine新发现:培育皿中的癌细胞与人体内癌细胞存在微小差别 |
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癌症是今朝灭亡率最高的疾病之一,迷信家们始终都在寻觅医治癌症的办法。近年来,免疫医治技术获得飞速倒退。癌症研讨普通从试验室培育各类各样的细胞系开端,通过分歧药物对这些细胞的杀伤后果,评价药物的疗效。这些细胞是科研职员通过分歧的渠道得到,通过构建癌症模子进行癌症生物学和开辟潜在的医治方式,然则很少有人去验证这些细胞系是否正确。
近期颁发于Genome Medicine一篇题为“Evaluating the transcriptional fidelity of cancer models”的文章,开辟一种新的、自立培训的盘算模子,借此评价分歧癌症研讨模子与原生肿瘤类似性。研讨成果显示,在几种罕用的研讨模子中,在培育皿中成长的人类癌细胞系在基因上与人体内的癌细胞最不类似,基因工程小鼠细胞与人体的类似性更高。
本盘算模子以RNA信息为根底。RNA是表白信息,不受变异的影响。研讨职员从TCGA数据库得到相关数据,包括数百例肿瘤患者样本的RNA表白信息,以及响应的分期、分级等肿瘤信息,确定22种可研讨的肿瘤类型,对来自天下各地试验室培育的657个癌细胞系、415个异种移动物、26个基因工程小鼠和131个类模子进行阐发。
研讨职员使用0-1评分办法对分歧肿瘤模子和原生肿瘤类似性进行评价,发事实验室培育的癌细胞系均匀评分要低于异种移动物、基因工程小鼠和类模子。这能够是因为成长情况之间的差别性形成的。是以建议研讨职员在进行癌症研讨之前必要对细胞进行郑重选择。(100yiyao.com)
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