甜瓜属染色体退化机制方面取得新停顿

近日，南京农业年夜学园艺学院陈劲枫传授团队在国内出名杂志《ThePlant Journal》上在线颁发了题为“Reconstruction of ancestral karyotype illuminates chromosome evolution in the genus Cucumis” 的研讨论文，该研讨应用本试验室开辟的高度可定制化的oligo-painting技术，构建了一个包括甜瓜属祖先核型的退化框架，偏重建了这些物种来源的退化轨迹和机制，答复了七条黄瓜染色体若何从十二条祖先染色体演变的这一迷信成绩，增进了对染色体的退化可塑性的意识。同时，该研讨为其他动物进行染色体退化的相关研讨树立一个典型利用案例。

由简单的染色体重排驱动的核型动静组成了退化学的一个根本成绩。比拟可以树立一个基于体系发育学的退化框架，从而重修造成当今动物核型的退化变乱。这个退化框架无疑可以成为揭开物种来源和驯化之谜的症结。然而，物种退化变乱的重修始终是一项具备挑战性的任务，特殊是在动物王国中。形式物种和作物的基因组测序名目的疾速添加，引发了人们对退化变乱实质的强烈趣味。然而，许多物种的基因组资本无限，特殊长短模子动物， 使得重修这一框架更具挑战性。

甜瓜属（Cucumis）属于葫芦科（Cucurbitaceae），包括约66 物种，包含在环球范畴内普遍散布的紧张经济作物，黄瓜（C. sativus，2n = 2x = 14）和甜瓜（C. melo，2n = 2x = 24）。虽然这些物种和人类之间存在着长达千年的联系关系，但这些物种和家养近缘物种之间的来源关系和退化变乱仍旧不分明，构建一个基于体系发育学的退化框架可以说明这个成绩，将为祖先若何演变成现存的甜瓜属物种提供新的见解。

本研讨在试验室已颁发的oligo-painting 技术根底上（Plant Journal，doi： 10.1111/tpj.14600），使用高度可定制化的比拟oligo-painting（comparative oligo-painting，COP），可视化了代表性甜瓜属物种的精密基因组构造，构建了一个包括祖先核型退化框架，从而说明了这些物种核型来源的的退化变乱，并证实了甜瓜属祖先核型（n = 12）通过频仍的杂交和系谱/物种特同性基因组重组而演变为现存的甜瓜属物种基因组。研讨成果标明，甜瓜属核型的分区退化可塑性的次要位于近着丝粒区域，这些区域因为其软弱性而在染色体退化中饰演紧张作用。同时，关于黄瓜和甜瓜染色体的来源-退化提供了新的意识。(100yiyao.com）