研讨职员提出一种用于鉴定微量样品m6A的高效便捷建库测序技术 |
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起源:中山年夜学 2021-09-10 07:00
中山年夜学性命迷信学院骆观正传授团队提出一种用于鉴定微量样品m6A的高效便捷建库测序技术,鉴定到数千个高反复性m6A位点,为匆匆进m6A功效研讨提供办法学立异。N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A) 是真核生物mRNA中含量最丰厚的碱基修饰类型,动静调控mRNA的剪接、定位、降解等多种代谢通路,进而参加细胞分解、肿瘤产生、免疫反馈等重中山年夜学性命迷信学院骆观正传授团队提出一种用于鉴定微量样品m6A的高效便捷建库测序技术,鉴定到数千个高反复性m6A位点,为匆匆进m6A功效研讨提供办法学立异。
N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A) 是真核生物mRNA中含量最丰厚的碱基修饰类型,动静调控mRNA的剪接、定位、降解等多种代谢通路,进而参加细胞分解、产生、免疫反馈等紧张心理进程。甲基化RNA免疫共积淀高通量测序(MeRIP-Seq 或m6A-Seq) 是今朝利用最普遍的m6A检测技术,但该技术通常必要年夜量肇端RNA样品( 100μg总RNA),难以利用于微量样品的m6A检测,限定了其在临床稀缺样品和晚期胚胎发育等场景中展开m6A研讨。是以,该畛域急需一种实用于低肇端RNA量、复杂快捷的m6A高通量测序技术。
该研讨提出一种m6A高通量测序新技术:tMeRIP-Seq。该技术通过多聚胸腺嘧啶引物特同性地反转录含有PolyA尾的mRNA,应用Tn5转座酶切割RNA/DNA杂合链的个性,将mRNA/DNA杂合链片断化同时加上测序接头,极年夜地下降样品初始投入量并简化试验操作。基于这一战略,该研讨以低至60ng总RNA为肇端模板,鉴定到数千个可反复m6A位点,这些位点特异地富集于基因3′末尾邻近,而且有典型的RRACH基序。之后研讨者利用该技术从一滴血中鉴定了m6A图谱,发现多个血液疾病相关基因能够受m6A调控。基于相似原理,tMeRIP-Seq技术将来还能够拓展到其它RNA修饰研讨中。(100yiyao.com)
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