生理所等研收回磁共振脑影像一键式数据处置与阐发软件平台

起源：生理所 2021-10-22 08:23

功效磁共振成像（Functional magnetic resonance imaging，fMRI）技术被普遍利用于无关认知、情绪、倒退和脑功效阻碍的脑迷信研讨中。然而，传统的基于三维体空间的磁共振阐发办法能够招致部门容积效应，即一个三维的脑区能够同时包括来自灰质、白质，乃至脑脊液的旌旗灯号。研讨发现人类脑功效因此年夜脑皮层外表的模式组织起来的，是以

功效磁共振成像（Functional magnetic resonance imaging，fMRI）技术被普遍利用于无关认知、情绪、倒退和脑功效阻碍的脑迷信研讨中。然而，传统的基于三维体空间的磁共振阐发办法能够招致部门容积效应，即一个三维的脑区能够同时包括来自灰质、白质，乃至脑脊液的旌旗灯号。

研讨发现人类脑功效因此年夜脑皮层外表的模式组织起来的，是以，越来越多的研讨开端运用基于皮层的脑影像预处置和算法。基于皮层的脑影像处置算法将年夜脑灰质重修成二维的皮层外表，可以更好地展示出年夜脑的沟回构造。尽管基于皮层的办法在年夜脑配准、信噪比和算法可反复性等方面均优于传统的体空间办法，但现有的业余脑皮层图像数据处置（如FreeSurfer等），要求使用者具备业余的编程技术，或不克不及笼罩脑成像数据阐发全流程需求，限定了此类办法的普及率和可应用性。是以，亟需研讨一个用户敌对的全流程的基于皮层的脑影像处置平台，以推进基于皮层的研讨办法的普及。

中国迷信院生理研讨所行动迷信重点试验室严超赣研讨组此前开辟了在畛域内广为风行的体空间脑影像处置平台DPARSF/DPABI，已被3000多项研讨利用并援用。

在此根底上，团队进一步单干开辟了基于年夜脑皮层的脑影像数据阐发软件DPABISurf，解决了基于体空间阐发漠视年夜脑按皮层延展个性的成绩，进步了脑旌旗灯号提取的敏理性和特同性，以及算法的可反复性。

DPABISurf基于fMRIPrep，联合了FreeSurfer、ANTs、FSL等畛域内较为先进图像处置软件模块，使用docker技术，提供了跨平台的简捷易用的运转界面和处置算法。DPABISurf可以一键式对功效磁共振数据进行基于皮层的数据预处置，并盘算皮层厚度、面积、曲率和皮层下核个人积等构造指标，盘算基于皮层的低频振幅（ALFF/fALFF）、局部一致性（ReHo）、度中间性（Degree Centrality）和功效连贯（FC）图等功效指标，提供基于皮层的图像统计和显示功效，并可自力于MATLAB运转。

DPABISurf的设计理念与DPARSF/DPABI雷同，这象征着年夜量DPARSF/DPABI用户可以从基于体空间的办法无缝切换到基于皮层的办法。DPABISurf将皮层阐发的技术门槛和培训难度下降，使得用户无需把握任何编程教训，也可纯熟精确地进行年夜脑构造皮层重修和基于皮层的功效阐发。(100yiyao.com）

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