组织染色质在血汗管疾病中的作用研讨

起源：本站原创 2021-10-27 10:06

近年来，在研讨真核基因组DNA三维构造的技术上取得了突飞大进的停顿。这种组织包含染色体区域、隔间、拓扑相关构造域(TADS)和调控元件之间的互相作用。

近年来，在研讨真核基因组DNA三维构造的技术上取得了突飞大进的停顿。这种组织包含染色体区域、隔间、拓扑相关构造域(TADS)和调控元件之间的互相作用。咱们当初相识到，在DNA复制、转录、维持和RNA加工进程中，高阶染色质组织是受调理的、是动静的，而且是调理基因组功效的根底。基因组组织被以为是细胞中随光阴动静变动的，以反映生物状态的差别。此外，基因在细胞群体中的表白是异质性的，这象征着在统一类型的单个细胞之间能够存在组织上的差别，例如加强子-启动子的打仗。是以，染色质组织是细胞表观状态的决议性因素。

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研讨职员多年来始终在研讨心脏中的染色质组织，并察看到在发育、分解或疾病等进程中，基因表白的差别与细胞核形态、年夜小或染色质密度的差别无关。然而，因为缺乏恰当的办法以足够的分辩率评价染色质动静，恒久以来，基因组组织变动和心脏发育或疾病之间的因果关系只是推测。然而，以后染色质构象捕获技术的倒退和利用提醒了心脏发育或病变进程中染色质组织、基因调控和功效之间的品级关系。

然而，即便是当初，年夜多半可用的办法倾向于以批量阐发的方式研讨数百万个细胞的基因组组织，这能够掩饰笼罩了对于特定细胞类型或单个细胞分辩率的组织的症结信息，而且能够不克不及精确地评价被查询拜访组织中的相关染色质构造。

在单细胞程度上丈量三维基因组组织的办法学挑战是微小的。加州理工学院(California Institute Of Technology)的研讨职员比来在《自然·生物技术》(Nature Biotechnology)上颁发的一项研讨中解决了这一挑战，他们开辟了一种技术，可以在数千个单个细胞中制造高分辩率的全基因组3D DNA组织图。

通过标签扩大（scSPRITE）的单细胞决裂池辨认互相作用使用决裂和池条形码来标志统一核内的DNA片断并映射其3D空间分列。因为scSPRITE可丈量多向DNA打仗，是以可在单个细胞内创立更高分辩率的图谱，可通过附近连贯完成。

在这种办法中，细胞被解离成单细胞悬浮液，随后是原位交联的DNA和卵白质复合物。紧随厥后的是细胞核的拆散和浸透。之后，对DNA进行消化，并利用两套分池条形码(Split-and-Pool Barcode)。起首，对来自统一细胞核的DNA片断进行三轮核条形码标志，然后对这些片断的3D分列进行三轮特别条形码标志。颠末六轮组合条形码后，scSPRITE可能保管每个复合体中无关细胞来源和空间DNA分列的信息。该技术宣称的紧张优点是它不必要专门的设备或训练，而且与其他现无方法相比，它在较年夜数目的细胞上从较少数目的测序读数中提供更高的分辩率。

研讨染色质组织在血汗管疾病中的作用--将来瞻望。

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一切心脏细胞类型的具体描写将进一步匆匆进咱们对心脏疾病时代紧张基因组拓扑变动的简单性的懂得。荣幸的是，基因组组织畛域正在迅速倒退新的、更先进的技术，以研讨单个细胞核内的3D基因组构造。将这些改良的技术利用于心脏生物学，将为咱们的心脏病理心理学常识添加一个新的维度，并有助于开辟新的、改良的心脏疾病医治办法。( 100yiyao.com)

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