CRISPR/Cas9组合挑选提醒了人类乳腺癌中互相作用的肿瘤克制基因和医治靶点的上位性网络 |
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起源:本站原创 2021-10-27 10:07
年夜多半癌症是由多种基因改动驱动的,但这些改动在肿瘤产生进程中是若何协同作用的仍旧是未知数。年夜多半癌症是由多种基因改动驱动的,但这些改动在肿瘤产生进程中是若何协同作用的仍旧是未知数。为明晰解克制基因(TSGs)之间匆匆进互相作用的机制,作者在人类乳腺上皮细胞中进行了组合CRISPR挑选和单细胞转录组阐发。
正如预期的那样,乳腺上皮细胞中分歧的驱动基因改动影响了可能诱导造成的抑癌基因改动库。更令人诧异的是,TSG互相作用网络由许多由3或4个基因构成的小集团组构成,以致于小集团中的每个TSG都与小集团中的一切其他基因显示出致癌单干。
互相作用阐发标明,次要单干的tsg具备堆叠的功效,而不是共同的或互补的功效。CRISPR双敲除的单细胞转录组阐发显示,协同匆匆进产生和成长因子自力的TSGs显示转录上位性,而非协同的TSGs则没有。这些上位性转录变动,既有缓冲作用,也有协同作用,影响了致癌介质和医治靶点的表白,包含CDK4、SRPK1和DNMT1。紧张的是,在该体系中,由PTEN和TP53等双失活的TSGs惹起的上位性表白改动也在患者中察看到,确立了这些发现与人类的相关性。

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