irf3绑定的lncRNA |
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来源:原创网站2021-11-25 12:45
干扰素调节因子3 (IRF3)是启动许多免疫反应的重要转导因子。
干扰素调节因子3 (IRF3)是启动许多免疫反应的重要转导因子。在这里,作者发现lncRNA-ISIR直接结合IRF3,促进其磷酸化、二聚化和核易位,增强靶基因的产生。体内lncRNA-ISIR缺乏导致IFN产生减少、病毒复制失控和死亡率增加。人类同源物AK131315也与IRF3结合并促进其活化。更重要的是,狼疮患者AK131315的表达与IFN-I水平和狼疮严重程度呈正相关。
在静息细胞中,IRF3机械性地与抑制蛋白Flightless-1 (Flightless-1)结合,使其保持无活性。感染后,ifn -i在细胞质dna结合区诱导lncRNA-ISIR与IRF3结合,并去除IRF3中fli1 s的结合,从而促进IRF3的激活。结果表明,ifn -i诱导的lncRNA-ISIR反馈可以通过消除免疫反应中被抑制的Fli-1来增强IRF3的激活,这揭示了一种调节lncRNA介导的转录因子(TF)激活的方法。
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精心设计的先天免疫反应,尤其是I型干扰素(IFN-I)的适当诱导,在宿主防御各种感染(尤其是病毒感染)和许多性疾病的发病机制中起着至关重要的作用。入侵病毒的核酸成分可被宿主保守模式识别受体(PRRs)识别,包括维甲酸诱导的基因I (RIG-I)、环GMP-AMP合成酶(cGAS)、异核蛋白A2/B1 (hnRNPA2B1)和toll样受体(TLRs)。
然后,通过包含在rig-I-线粒体抗病毒信号蛋白(MAVS)、cgas干扰素基因刺激因子(STING)和TLR3-TIR结构域中的衔接子,诱导信号衔接子如干扰素B (TRIF)激活免疫信号级联,然后招募并激活tank结合激酶1 (TBK1),再磷酸化转录因子(TF) IRF3。IRF3磷酸化后形成同型二聚体,再转移到细胞核,与其他转录因子(如IRF7)协同诱导ifn,主要是ifn-I和大量的ifn刺激基因(ISGs),保护宿主免受病毒感染。在大多数细胞类型中,IRF3组成型表达,激活后会刺激IRF7的表达,而IRF7仅在浆细胞样树突状细胞(pDCs)和巨噬细胞中组成型表达。
IRF3作为一种重要的转录因子,在免疫应答中对产生IFN-I至关重要。IRF3功能障碍可引起免疫系统紊乱,包括炎症性疾病、淋巴系统疾病、慢性传染病等。到目前为止,已经揭示了许多不同水平的调节机制来调节IRF3的功能。据报道,衔接子MAVS、STING和TRIF的pLxIS基序的磷酸化导致IRF3的募集,这使得IRF3被TBK1磷酸化。
接下来,IRF3二聚并与GREBBP形成复合物,该复合物被转运至细胞核。此外,IRF3可以被RACK1-PP2A复合物去磷酸化,然后在细胞质中恢复静止状态。虽然已经报道了许多IRF3相关蛋白,但仍需充分了解如何抑制结合蛋白和IRF3 RNA结合来调控IRF3的激活。
越来越多的长非编码RNA (LNC RNA)被报道用于决定免疫发育和调节免疫反应,如CD8 T细胞建立中的lncRNA-Snhg1、树突状细胞成熟中的lnc-DC和癌症免疫逃逸中的NKILA。Lncrna可能以不同的方式发挥其生物学功能。
Irf3结合的lncRNA-ISIR可增强病毒感染和自身炎症中干扰素的产生。
图像来源:
考虑到IRF3上的dna结合域(DBD)的核酸结合潜力,作者假设可能有lncRNA与IRF3相互作用,IRF 3参与调节抗病毒免疫反应。通过甲醛交联RNA免疫沉淀和RNA测序,作者发现了一个未描述的irf3结合的lncRNA,即lncRNA-
病毒感染时诱发的Isir来自基因中的非编码基因。IRF3以单体形式与肌动蛋白重塑蛋白Fli-1结合,在未刺激的细胞中保持沉默。
激活后,lncRNA-ISIR被IFN-I诱导,与IRF3结合,阻断其与抑制蛋白Fli-1的连接,促进IRF3磷酸化、二聚化和核易位,从而增强IRF3在体内外引发的免疫应答。这项工作揭示了lncRNA更有效的作用方式,即直接与免疫反应因子TF结合并调节其活性。(100yiyao.com)
参考
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