别再被“垃圾DNA”忽悠了!三个非编码RNA相互勾结促癌! |
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Non-codingRNA (ncRNA)是指不编码蛋白质的RNA,以前被认为是“垃圾RNA”。
随着RNA研究的深入,人们发现非编码RNA的突变或异常表达与许多疾病的发生密切相关。NcRNA可以分为不同的长度。比如长度大于200nt的ncRNA称为长链(lncRNA),而长度小于50nt的称为小RNA,包括我们熟悉的。
此外,ncRNA还可以根据其形态结构分为线性和非线性,环状RNA(circRNA)是一种特殊类型的具有封闭环状结构的ncRNA。细胞中ncRNA含量最高的是rRNA和tRNA,这两个基因已经研究得比较透彻了。近年来,细胞内lncRNA、miRNA和circRNA及其调控网络的生理和病理机制越来越受到人们的关注。
以往的研究证实,circRNA可以作为miRNA的海绵,解除miRNA对靶基因的抑制,从而调控基因表达,在疾病的发生发展中发挥重要作用。非编码RNA不仅是“垃圾RNA”,还可能动员其他类型发挥重要作用!
来自香港中文大学医学院,中山大学第七附属医院研究团队在分子癌症在线发表了一篇题为《Circ RTN 4通过Novell Circ RNA-mirna-lncrnapathway和稳定表观遗传-间充质转换蛋白促进胰腺癌进展》的文章。研究人员在胰腺导管腺癌(PDAC)中发现了一种新的circRNA- miRNA-lncRNA信号通路,这三种分子都是。除了调节lncRNA的表达,研究还发现circRTN4可以与上皮-间充质转换(EMT)驱动蛋白RAB11FIP1相互作用,增强其稳定性,促进EMT。这些结果拓宽了对环核糖核酸在调节PDAC基因表达中的作用的理解。
在先前工作的基础上,研究人员将注意力集中在一种叫做环状核糖核酸的环状核糖核酸上。细胞水平检测显示,circRTN4在几种不同类型的PDAC细胞系中显著上调。在88例PDAC患者中,环核蛋白4上调患者的比例高达60%。此外,在结直肠癌、喉鳞状细胞癌、头颈部鳞状细胞癌、卵巢癌、肾癌等肿瘤中也发现了类似的结果。研究团队分析了circRTN4表达水平与临床特征的相关性,发现PDAC肝转移患者原发肿瘤中circRTN4表达水平显著上调,提示PDAC原发肿瘤中circRTN4表达上调可能与肝转移有关。
为了验证这种相关性是否是因果关系,研究人员在细胞水平进行了circRNA敲除实验,发现敲除circRNA后,PDAC细胞系的增殖、克隆形成、迁移和侵袭能力明显弱于对照组。
基于小鼠移植瘤模型的体内实验进一步证实,circRNA的生长减慢,凋亡增加,肝转移减少。
体内外实验结果充分证明了circRTN4在促进PDAC细胞生长和侵袭中的重要性。接下来,研究人员试图找出这种分子的具体分子机制。在预测的帮助下,研究人员筛选出可能与circRTN4结合的miRNA,然后通过荧光素酶报告分析、miRNA下拉、生物素标记等实验手段证实了circRTN4与PDAC细胞中miR-497-5p的相互作用,circRNA通过经典的“海绵”效应抑制了miR-497-5p的功能。
许多文献报道miR-497-5p可以靶向致癌HOTTIP-HOXA13通路(HOTTIP是HOXA 5’端的长链)。HOTTIP-HOXA13与疾病发生密切相关)在PDAC发挥抗癌作用。
那么,circRTN4会通过“勺子”效应抑制PDAC的miR-497-5p,从而调控HOTTIP-HOXA13通路吗?相关实验数据表明,circRTN4确实通过抑制miR-497-5p而影响lncRNA HOTTIP的表达。在PDAC首次发现了由三种不同类型组成的信号轴circrtn 4-mir-497-5p-lncrnahottip。
虽然圆环RNA-miRNA相互作用模式是PDAC报道最多的圆环RNA模式,但很多细胞系中圆环RNA的丰度远低于miRNA,这表明在PDAC,圆环RNA可能有其他独立于miRNA的机制。为了解决这个问题,研究人员Cirrtn4寻找与其相互作用的蛋白质,并鉴定了EMT驱动因子RAB11FIP1及其与cirRTN4的结合位点。一系列实验结果表明,cirRTN4可以通过阻断RAB11FIP1的泛素化来稳定RAB11FIP1,促进N-钙粘蛋白、Slug、Snai1、Twist和Zeb1等EMT通路关键分子的表达,最终促进PDAC的EMT。(100yiyao.com)
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