Nat Commun:科学家成功绘制了新的结肠基因图谱 这可能有助于阐明许多肠道疾病的分子机制

来源：原网站2022-02-21 22:25

来自瑞典卡罗琳研究所和其他机构的科学家利用空间转录组学技术分析了小鼠结肠中的基因表达，从而创建了一个显示组织中单个基因表达位置的图谱。当研究人员将之前已知的人类转录数据叠加到图谱上时，他们对炎症性肠病有了新的认识。

2022年2月21日/100医学网BIOON/-肠道屏障是由一个复杂的细胞网络组成，它定义了高度分隔和特化的结构。最近，在国际期刊《自然通讯》上发表的一篇题为“愈合小鼠的空间转录组学景观”的研究报告中，瑞典卡罗琳研究所和其他机构的科学家利用空间转录组学技术分析了小鼠结肠中的基因表达，从而创建了一个显示组织中单个基因表达位置的图谱。当研究人员将之前已知的人类转录数据叠加到图谱上时，他们对炎症性肠病有了新的认识。

小鼠结肠特定腔内基因表达程序。

图片：Ludvig Larsson

在这篇论文中，研究人员使用了一种称为空间转录组学的技术来绘制小鼠结肠中单个细胞的基因活动。据研究人员介绍，这是他们第一次更直观地观察到整个肠道的基因表达蓝图，包括健康和受伤后的恢复等。爱德华多j维拉布兰卡(Eduardo J. Villablanca)博士表示，我们由空间转录组学驱动的可视化研究可能会促使我们发现许多以前未知的方面，例如结肠可以分成比以前认为的更多的部分。

当科学家将研究结果与已知的人体组织转录组数据相结合时，他们注意到一些肠道细胞的位置在小鼠和人体中可能是相同的，这使得该模型成为一种有效的工具，有助于研究不同疾病的分子机制，如影响结肠健康的炎症性肠病。在早期的研究中，研究人员表示，溃疡性结肠炎可以分为两种基因表达不同的亚型，而参考这种新的图谱，研究人员发现，更难疾病形式的基因可能存在于受损更严重的组织中。同样，基因图谱可能被用于观察人类基因在结肠中的活跃位置，这可能为科学家开发新的疗法和药物提供新的思路和希望。

空间转录组技术有助于直观地研究和分析组织中的基因表达。然而，为了可视化结肠等长管状器官，这项研究背后的科学家需要以新的方式应用这项技术。通过像瑞士卷轴一样滚动结肠，研究人员或许能够成功适应并绘制出长型器官的整个基因表达图谱。目前，研究人员希望使用相同的方法为所有消化器官(从口腔到直肠)创建一个类似的图谱，他们的目标是为所有组织的基因表达创建一个参考图谱。

图片：https://www.nature.com/articles/s41467-022-28497-0

整个消化器官的基因图谱可能在许多方面发挥重要作用，例如，它可以帮助探索肠道菌群与细胞基因表达的关系，更好地了解不同饮食如何影响机体的各种功能；综上所述，本研究结果表明，研究人员提供了一个开放的资源，它可能定义了结肠黏膜愈合过程中转录组的区域化原则，并提供了一个框架来发展和促进进一步的假设和研究。(100yiyao.com 100医疗网)

原始来源：

Parigi，S.M .Larsson，l .Das，s .等人。全国社区13，828 (2022年)。doi:10.1038/s41467-022-28497-0

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