代谢组学揭示线虫脂肪代谢途径 |
![]() |
来源:原创网站2022-03-09 17:16
高分辨率质谱的非靶向代谢组学可以揭示单个样品中超过100,000种分子特征,其中许多可能代表未知的代谢物。其中许多代谢产物可能具有重要的生物学功能,如细胞内或细胞间的信号分子,如激素,或组织间水平的通讯介质,如宿主-微生物相互作用或信息素。然而,代谢物的高度不规则且通常不可预测的结构对系统的化学和生物学注释提出了巨大的挑战。
高分辨率质谱的非靶向代谢组学可以揭示单个样品中超过100,000种分子特征,其中许多可能代表未知的代谢物。其中许多代谢产物可能具有重要的生物学功能,如细胞内或细胞间的信号分子,如激素,或组织间水平的通讯介质,如宿主-微生物相互作用或信息素。然而,代谢物的高度不规则且通常不可预测的结构对系统的化学和生物学注释提出了巨大的挑战。
在本研究中,研究人员引入了开源的非靶向比较代谢组学分析平台Metaboseek,并以秀丽隐杆线虫为模型,揭示了保守脂肪代谢途径-氧化的生物合成功能,展示了该平台的实用价值。Metaboseek是一个模块化的软件平台,提供了从特征检测到化合物鉴定的全面数据分析工作流程,专门用于非靶向代谢组学分析。
比较代谢组学的代谢物分析
研究人员使用metaboseek整合分子特征检测、统计、分子式预测和片段分析等模块,研究线虫体内的过氧化物酶体-氧化(po),这是一种保守的脂肪酸降解途径,补充-氧化,分解-支链脂肪酸。-氧化同时发生在线粒体和过氧化物酶体中,而-氧化只发生在过氧化物酶体中,过氧化物酶体是膜结合的代谢区域,在脂质和胆汁酸代谢中与其他细胞器协同作用。Metaboseek用于对po突变体进行非靶向比较代谢组学研究。研究人员发现,破坏线虫po会导致100种代谢物的积累,其中大部分尚未报道。
秀丽隐杆线虫基因hacl-1编码一种与人HACL 1有49%相同的酶,并在氧化途径中起重要作用。通过野生型线虫和-氧化缺陷型hacl-1突变体之间的非靶向比较,发现了200多种-氧化依赖性代谢产物。这些代谢产物支持HACL-1的酶功能预测,表明-氧化参与了食物来源的内源性-甲基支链脂肪酸和环丙烷脂质的代谢。
本研究通过新化合物的发现及其特征的大规模注释,将非靶向比较代谢组学应用于保守性主要代谢途径的分析,提出了环丙烷脂质代谢模型。(100yiyao.com 100医疗网)
参考文献:Helf,M.J .Fox,B.W .Artyukhin,A.B .等.用元数据库比较代谢组学seek返回秀丽新杆线虫中保守脂肪代谢组学途径的功能13,782 (2022)。
版权声明
本网站所有标注“来源:100医学网”或“来源:bioon”的文字、图片、音视频资料,均属于100医学网网站的版权。未经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,否则将追究法律责任。获得书面授权转载时,必须注明“来源:100医学网”。其他来源的文章都是转载。本网站所有转载都是为了传递更多信息。转载内容不代表本网站立场。不希望被转载的媒体或个人可以联系我们,我们会立即删除。
87%的用户在用100医网APP随时阅读、评论、分享。请扫描二维码下载-

- 相关报道
-
- J Hematol Oncol:突破T细胞白血病治疗瓶颈——双靶点CAR-T细胞有望带来新希望 (2025-07-09)
- 《自然·医学》:世卫组织最新预警!全球08-17年出生的人,或有1560万会患胃癌,76%归因与幽门螺杆菌感染,2/3发生在亚洲 (2025-07-09)
- 精鼎医药宣布两位 FDA 权威专家加入我司咨询团队,进一步增强监管事务、医学及 AI 领域专业实力 (2025-07-08)
- Mater Today Bio:干细胞球联手纳米颗粒水凝胶精准改善糖尿病创面环境,加速伤口愈合新突破 (2025-07-08)
- J Anim Sci Biotechnol研究揭秘美味密码:益生菌联手重塑肠道菌群,经肠-肌轴提升猪肉鲜味与品质 (2025-07-08)
- Science:告别序列依赖,为你的染色体“扫码”——每条染色体竟自带独一无二的“条形码 (2025-07-07)
- 《自然》子刊:刷新认知!哈佛团队发现,乙肝病毒自身或不致肝癌,但会增强致癌物的作用 (2025-07-07)
- 《科学》子刊:科学家揭示帕金森病中不同的发病轨迹,或为定义亚型和治疗靶点提供新见解! (2025-07-07)
- 《细胞》破解常见痴呆的治疗难题!“老药新用”有望恢复大脑功能 (2025-07-07)
- 华人学者本周发表4篇Cell论文:高度血管化的肺/肠道类器官;修复血管性痴呆;自身免疫病新疗法;同义突变调控性状 (2025-07-07)
- 视频新闻
-
- 图片新闻
-
医药网免责声明:
- 本公司对医药网上刊登之所有信息不声明或保证其内容之正确性或可靠性;您于此接受并承认信赖任何信息所生之风险应自行承担。本公司,有权但无此义务,改善或更正所刊登信息任何部分之错误或疏失。
- 凡本网注明"来源:XXX(非医药网)"的作品,均转载自其它媒体,转载目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责。本网转载其他媒体之稿件,意在为公众提供免费服务。如稿件版权单位或个人不想在本网发布,可与本网联系,本网视情况可立即将其撤除。联系QQ:896150040