《癌细胞》:癌症液体活检新突破！血小板RNA谱可以准确区分癌症类型和分期！

来源：奇点蛋糕2022-10-26 18:02

通过癌症数据的大样本，本研究发现来源于血小板的RNA谱可以有效地诊断多种癌症，并追溯癌症病变的起源。

众所周知，早期癌症的生存预后与晚期癌症有很大不同。在早期发现和治疗癌症可以显著改善癌症的总体生存预后。近年来，以循环游离DNA(cfDNA)为研究核心的液体活检技术在癌症中发挥了重要作用[1]，但在癌症早期，患者血浆中cfDNA的含量较低[2]。因此，开发新的液体活检指标对于癌症的早期筛查和改善预后非常重要。

血小板在血液中大量存在，容易分离。除了正常的凝血功能外，它们在炎性疾病的发生、癌症进展和转移中的作用已被广泛研究，并且它们可用作癌症检测的可靠生物来源。

以前的研究表明，肿瘤来源的RNA可以从血小板中分离出来，肿瘤也可以通过改变血小板的RNA谱来诱导血小板。源自肿瘤诱导的血小板(TEP)的RNA谱可能是特异性的，或者可用作局部和转移性癌症的辅助方法。

最近，荷兰阿姆斯特丹癌症中心和液体活检中心的托马斯沃丁格和米隆g贝斯特领导的研究小组在CancerCell上发表了一项重要的研究成果。他们发现，利用TEP衍生的RNA表达谱可以检测出18种癌症，与健康对照组相比，特异性达99%，对多期肿瘤具有很高的诊断价值[5]。

图一。文章首页截图

为了精确计算血小板RNA谱诊断癌症的能力，研究人员通过迭代建模的方法构建了泛癌的thromboSeq算法模型，并对算法进行了优化，实现了追踪原癌病灶的能力(图2)。

在对血小板RNA测序后，研究人员进行了严格的质量控制。最终从13个机构采集了2351份血小板样本，其中癌症患者1628份(涵盖18种肿瘤)，健康人390份，炎症/心脏病/良性肿瘤患者333份，用于随访分析。

图二。泛癌算法模型

基于这种算法模型，研究人员想知道我们是否可以利用TEP衍生的RNA谱来开发一种早期特异性检测癌症的方法，从而在癌症的准确诊断中发挥作用。

于是研究人员对计算模型进行了评估，并用大样本进行了验证，其中391个样本用于模型构建，385个样本用于模型评估。575个样本(包括1096名癌症患者、146名健康人和333名非癌症患者)用于模型验证。