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Polycomb蛋白复合物对基因表达的抑制是调控胚胎发育和细胞类型规范的基本机制。Polycomb抑制性去泛素酶(PR-DUB)复合物去除核小体上组蛋白H2AK119单泛素化(H2AK119ub1)的泛素部分,抵消Polycomb抑制性复合物1 (PRC1)的泛素E3连接酶活性,以促进Polycomb蛋白对基因的正确沉默,并保护活性基因免受PRC1的无意沉默。PR-DUB复杂的生物学功能需要H2AK119ub1的精确靶向,但PR-DUB可以不加区别地去泛素化;因此,其微妙的核小体依赖底物特异性的基础仍然不清楚。
2023年3月29日,中国科学院生物物理研究所许瑞明及朱冰共同通讯在Nature在线发表题为 Basis of the H2AK119 specificity of the Polycomb repressive deubiquitinase 的研究论文,该研究报道了人PR-DUB(由BAP1和ASXL1组成)与染色小体(Chromatosome)复合物的冷冻电镜结构。
该研究发现ASXL1除了在形成泛素结合裂缝中起作用外,还指导BAP1的带正电荷的C端延伸与二分体附近的核小体DNA和组蛋白H3-H4结合。此外,BAP1催化结构域的一个保守环段位于H2A-H2B酸性斑块附近。这种独特的核小体结合模式将H2A的C端尾部从核小体表面取代,并赋予PR-DUB对H2AK119ub1的特异性。
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