Nature:王艳丽团队等揭示新型anti |
来源:生物世界 2024-07-06 12:23
AcrIF25的发现不仅为理解CRISPR-Cas系统的抑制机制提供了新的见解,而且为开发新型的生物技术工具提供了重要的启示。加拿大多伦多大学Alan Davidson团队和中国科学院生物物理研究所王艳丽团队(Chantel Trost博士为论文第一作者)合作,在Nature期刊发表了题为:An anti-CRISPR that pulls apart a CRISPR Cas complex的研究论文。
该研究发现了一种新型anti-CRISPR蛋白 AcrIF25,能够通过解离I-F型CRISPR-Cas复合体(Csy复合体)的方式抑制CRISPR-Cas系统的活性,为CRISPR-Cas系统的精确控制提供了新思路。
在I-F型CRISPR-Cas系统中,效应复合体称为Csy复合体,由CRISPR RNA(crRNA)和4种Cas蛋白组成。Cas5和Cas8形成异二聚体与crRNA 5 端结合,Cas6与crRNA 3 端的发卡结构结合,六个Cas7亚基沿着crRNA中间排列组成复合体的骨架结构。Csy复合体特异性识别外源核酸,并招募Cas3核酸酶将其降解。目前,已知的大多数I-F型Acr蛋白通过直接与Csy复合体结合,从而抑制CRISPR-Cas系统。
在这项研究中,研究团队首先通过的方法鉴定出了一种新的anti-CRISPR蛋白,命名为AcrIF25。噬菌斑实验显示,AcrIF25能够显著抑制铜绿假单胞菌I-F型CRISPR-Cas系统的活性。为了确认AcrIF25是否能够直接结合Csy复合体,研究人员将纯化的AcrIF25 与Csy复合体混合并进分子排阻凝胶层析。令人惊讶的是,AcrIF25没有与完整的Csy复合体结合,而是与其中的Cas7亚基结合,并将Cas7从完整的Csy复合体中分离出来,留下Csy复合体的其余组分(Cas5、Cas6、Cas8 和 crRNA)。
为了进一步阐明AcrIF25作用机制,研究团队解析了AcrIF25以及Cas7:AcrIF25复合体的晶体结构。AcrIF25的N端结构为典型的RHH折叠,C端由5个 -螺旋形成螺旋束。AcrIF25的C端结构域与Cas7形成大面积的相互作用,通过分析完整 Csy 复合体中两个相邻 Cas7 亚基与 crRNA 之间的相互作用,研究团队发现 AcrIF25结合Cas7的区域覆盖了Csy 复合体中相邻Cas7之间的结合界面以及Cas7与crRNA的结合界面,AcrIF25正是通过结合这些关键位置从而阻止Cas7与其他Cas7亚基和crRNA相互作用,进而使得整个复合体解体。这种 拆除 效应使得CRISPR-Cas系统无法有效地识别并切割外源DNA。
此外,以前发现的能够解离大分子复合体的蛋白质需要利用ATP 水解提供的能量。而AcrIF25不包含ATP结合或水解相关的结构域,生化实验显示,AcrIF25将Cas7从Csy复合体中解离出来不需要水解ATP提供额外的能量,显示了AcrIF25机制的独特性。
AcrIF25解离Csy复合体的分子机制
综上所述,AcrIF25的发现不仅为理解CRISPR-Cas系统的抑制机制提供了新的见解,而且为开发新型的生物技术工具提供了重要的启示。随着对AcrIF25及其类似Acr蛋白的进一步研究,有望开发出更加高效、安全和可控的基因编辑和基因治疗技术。
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