Gut：上海交大/浙大团队共同揭示“点燃”胰腺癌免疫微环境的表观遗传治疗靶点!

来源：奇点糕 2024-09-06 14:37

在本次研究中，研究者们进行了专门的CRISPR-Cas9表观遗传体外筛选，结果显示，仅有敲除胰腺癌细胞的Med12，会在小鼠实验中显著影响成瘤速度和免疫微环境。

近日，上海交通大学医学院附属仁济医院薛婧、王宇团队与上海交大基础医学院唐玉杰，浙江大学王超尘等国内外研究者合作在Gut期刊发表的最新研究成果，就揭示了经由内源性逆转录病毒元件（Endogenous Retroelements，ERs）和表观遗传机制，对抑制性微环境有重要调控作用的靶点MED12，它可能是免疫治疗攻破胰腺癌的全新突破口！

研究者们借助CRISPR-Cas9筛选出具有强力免疫抑制效应的MED12后，揭示了MED12的具体作用机制：MED12可稳定异染色质蛋白1A（HP1A），使其抑制H3K9me3标记的ERs，而Med12缺失所导致的逆转录转座子去抑制，会激活人体内经典的、由胞质核酸感知通路激活的固有免疫应答，使胰腺癌免疫微环境变为利于免疫治疗的炎症型（Inflamed），为免疫治疗铺平道路。

论文首页截图

相信各位都知道胰腺癌的肿瘤微环境有多么让免疫治疗绝望，奇点糕就不用铺垫了，直接快进到发现MED12靶点的环节吧？从表观遗传的角度入手，此前在胰腺癌中还不算多，但借助ERs破局倒真不是什么异想天开，早先就有学者撰文提出，在肿瘤、自身免疫疾病等不同的应用场景中，ERs可能诱导的免疫应答各不相同，有些或许就可利用[1]。

在本次研究中，研究者们进行了专门的CRISPR-Cas9表观遗传体外筛选，而在筛选出的多个影响胰腺癌抗应答的调控因子中，仅有敲除胰腺的Med12，会在小鼠实验中显著影响成瘤速度和免疫微环境；且在免疫健全小鼠身上，敲除Med12会使肿瘤微环境内浸润的CD8+T细胞、NK细胞和NKT细胞数量大增并功能增强，免疫微环境整体呈炎症型表现，利好免疫治疗。

敲除Med12使胰腺癌免疫微环境转变为炎症型，利好此前束手无策的免疫治疗

做到这一步当然还不够，知其然要知其所以然嘛，于是研究者们开始探索敲除Med12增敏免疫治疗的具体机制。基因集富集分析（GSEA）首先提示，敲除Med12后表达上调的基因主要与内源性抗原肽处理和呈递（由MHC-I类分子进行）有关，同时还有NF- B和干扰素- 通路相关基因的显著富集，到这里的发现还算是意料之中。

但接下来，研究者们在敲除Med12的胰腺癌细胞内意外发现了大量的内源性双链DNA（dsDNA），同时细胞内感知dsDNA/RNA的关键基因表达也显著上调，意味着NF- B和干扰素- 通路的激活，是由于dsDNA被胞质核酸感知通路察觉，拉响了外敌入侵的警报；而敲除Mda5、Ddx58两个胞质核酸感知通路中的关键基因，就会使敲除Med12激活的免疫应答消失。

敲除Med12可经由胞质核酸感知通路，激活关键抗肿瘤免疫应答通路

而人体内dsDNA的主要来源，就是奇点糕一开始提到的 伏笔 ERs，研究者们也通过染色体可及性测序（ATAC-seq）和RT-qPCR证实，敲除Med12激活了ERs，使其中逆转录转座子的染色质可及性增强；同时，敲除Med12也使HP1A蛋白的稳定性下降（MED12可直接结合它来增强稳定性），削弱了HP1A下游原本专门负责沉默逆转录转座子的H3K9me3调控强度。

此外研究者们还发现，敲除Med12上调了染色质上大部分转座子（TEs）部位的H3K27乙酰化修饰水平，这是逆转录转座子进入转录激活状态的原因，也解释了前面dsDNA的来源和胞质核酸感知通路激活，启动固有免疫通路的环节；与上述发现一致，人类胰腺癌患者的MED12蛋白或Med12 mRNA水平，也与免疫治疗应答和生存预后直接挂钩，说明MED12同时具有成为治疗靶点和Biomarker的潜力。

敲除Med12会增加转座子H3K27乙酰化修饰，以此激活免疫应答

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