中国农业迷信院生物所绘制水稻根组织单细胞图谱

近日，中国农业迷信院生物技术研讨所谷晓峰团队和单干者绘制了票据叶形式动物水稻首个根组织单细胞分辩率转录组图谱，为研讨动物细胞类型特化、功效和退化提供了新的路径。相关成果颁发在国内学术期刊《分子动物（Molecular Plant）》上。

在动物整个性命进程中，根尖在不时地分解发育，造成的根系从泥土中排汇水分和矿质元素，参加动物与生物或非生物旌旗灯号的互作，并起到固定植株的作用。然则，动物根系的发育及与情况互作的分子机制还知之甚少。研讨职员对两个水稻栽培亚种粳稻Nip（Oryza sativa L. japonica. cv. Nipponbare， geng）和籼稻93-11（Oryza sativa L. indica. cv. 93-11， xian）10，968和12，564个根尖细胞进行了单细胞转录组测序和阐发，鉴定出8个细胞型。对Nip和93-11每种细胞型差别表白基因进行功效富集阐发，发现年夜多半基因与情况相应无关，分歧水稻亚种在遭到内部情况刺激时相应机制存在差别。

研讨职员随后对水稻单细胞数据进行拟时候析，绘制了根最外层细胞的发育轨迹，来自两个栽培种类的单细胞轨迹显示高度一致的拟时次序，标明分歧亚种之间发育轨迹的激进性。进一步联合已颁发的双子叶形式动物拟南芥根尖单细胞转录组数据集进行了比照阐发，这是初次在单细胞程度进行动物组织器官退化阐发，发现拟南芥和水稻年夜部门细胞类型转录组之间差别较年夜，只有根毛细胞相关性较高，进而从单细胞程度上阐释了单/双子叶动物根系类型分解的根底。

生物所谷晓峰研讨员和德国海德堡年夜学Jan U. Lohmann为论文通信作者，该任务获得了国度严重专项、央级公益性科研院所根本科研营业费、中国农科院科技立异工程名目赞助。(100yiyao.com）