华年夜智造基因测序仪助力我国发现首例境外变种新冠毒株 |
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近日,中国疾控中间周刊(China CDC Weekly)在最新一期登载的文章中称,2020年12月14日,我国海关试验室监测到一名坐飞机从境外前往的23岁女性新冠感化者,通过检测发现,该病例感化了新变种的新冠毒株。
值得一提的是,这次助力发现我国首例境外变种新冠毒株的测序平台是华年夜智造自立研发的一款玲珑机动、性能微弱的高通量测序仪——MGISEQ-200。
中国疾控中间周刊依据近日多方披露的研讨数据,从境外开端风行的这种新病毒株的传达才能预计比一般病毒株至多要超过跨过50%。虽然今朝尚无证据标明这种新的病毒株加倍致命或许会惹起更重大的疾病,但其仍被以为是对中国预控新冠疫情组成微小的潜在威逼。据相识,中国疾控对一切病毒株都有体系监测,在检测到第一株VOC毒株后就已上报,并在中国疾控民间杂志China CDC Weekly(中国疾控周报)中向环球宣布。据披露,疾控中间对该患者的核酸样本以多重PCR方案建库,并使用华年夜智造高通量测序平台MGISEQ-200对病毒核酸文库进行深度测序。
通过对MGISEQ-200的测序数据进行生信阐发,研讨职员发现,该毒株与11月份监测到的毒株分歧,显示32个核苷酸变异位点,通过进一步比照发现,该患者感化的毒株基因序列中包括了10月下旬开端在境外风行的VUI202012/01新病毒株中一切的28个变异点位,此中包含刺突卵白中的3个氨基酸缺失和7个氨基酸渐变。基于MGISEQ-200的测序数据和风行病学查询拜访成果,国度疾控将此境外输出性病例界说为中国监测到的首例英国变种VUI202012/01病毒株,并增强了对患者亲密打仗的查询拜访和对相关场合的消杀。
基于MGISEQ-200测序数据组装的COVID-19全基因组序列体系退化树。境外变异毒株种系VUI-202012/01变体以深绿色突出显示,上海初次检测到的VUI-202012/01变体以红点表现新冠病毒的不时变异是以后环球面临的一年夜挑战,华年夜智造自立研发的高通量测序仪以其高妙度、高精度的个性,可以对病原全基因组序列进行深度测序,找到病毒渐变位点,辨明病毒身份,从而找到病毒起源。
华年夜智造MGISEQ-200是一款玲珑机动且性能微弱的高通量测序仪,它可以完满适配病原检测、组装以及溯源等利用,知足对疾病精准防控的需求。此外,该测序平台现已推出全新设置装备摆设,支持更多极度文库测序,年夜幅提升测序速率。
今朝,MGISEQ-200已入驻环球多个国度海关试验室、疾病预防节制中间,为疫情一线提供了症结性支持。
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