迷信家应用纳米孔测序同时获取染色质可及性和甲基化信息

近年来跟着DNA测序技术的发达倒退，卵白质联合位点的高通量鉴定、染色质可及性及甲基化状态阐发等检测技术不时涌现，此中好多技术（如DNase-seq和ATAC-seq等）依赖于开放性染色质对转座酶等的敏理性。在这些新技术中，全基因组核小体定位及DNA甲基化组测序技术（NOMe-seq）可能应用外源性M. CviPI GpC甲基转移酶标志基因组可及性区域，联合亚硫酸氢盐转换，NOMe-seq可能同时检测内源性胞嘧啶甲基化和核小体开放性状态。

孔测序（Nanopore sequencing， 又称第四代测序）是近年来鼓起的新一代单分子测序技术，具备测序读长（reads）长（ 150 kb），速率快，测序数据及时监控，机械不便携带等优点。之前研讨已证实孔测序可能检测内源性CpG甲基化，并能对乃至人类细胞的染色质可及性位点进行外源标志。

约翰霍普金斯年夜学Winston Timp传授引导的研讨团队在Nature Methods杂志颁发了题为“Simultaneous profiling of chromatin accessibility and methylation on human cell lines with nanopore sequencing”的研讨论文，作者通过GpC甲基转移酶外源性标志开放染色质后，应用孔测序技术（nanoNOMe-seq）同时检测了人类细胞中的内源性CpG甲基化状态和染色质可及性的阶段性形式，构建了涵盖甲基化和染色质开放性信息等在内的人类细胞表观基因组，并应用该技术提醒了细胞和非癌细胞间的表观差别。nanoNOMe-seq为咱们提醒人类发育与疾病产生中简单的染色质特征提供了新的技术支持。(100yiyao.com）