研讨解析桃扁平果形调控机制

北京市农林迷信院谢华/姜全团队在桃高质量基因组组装和基于构造变异图谱解析桃扁平果形机制方面取得了突破性停顿。相关研讨论文“Genome structure variation analyses of peach reveal population dynamics forbid a 1.67？Mb causal inversion for fruit shape”于近日在国内权势巨子期刊《Genome Biology》（IF= 10.806）正式在线颁发。

果形圆/扁是桃果实最紧张的外观品质之一，受6号染色体上S位点节制，此位点果形决议基因始终是研讨热门。针对这一成绩，基于高妙度的PacBio和Illumina测序数据，实现了我院培养的蟠桃种类“瑞油蟠1号”高质量基因组de novo组装（Contig N50高达11.5 Mb），是迄今为止组装质量最高的桃基因组；联合各次要产区的桃种类高妙度重测序数据，构建了高质量的桃遗传变异图谱；通过比照别离基于SNP、InDel和SV的全基因组联系关系阐发，发现一个1.67 Mb的杂合倒位构造变异与果实扁表型共拆散；通过eGWAS办法，确定了该变异与其下游的PpOFP2基因表白量显着联系关系；通过番茄转基因试验验证了该基因对果实纵向成长的负调控作用。基于该项研讨结果，开辟了用于桃育种果形晚期检测的PCR引物，精确率达100%，已申请国度创造专利。该研讨为展开桃优异种质基因资本的挖掘、说明桃紧张农艺性状造成的机制提供了紧张资本和思绪自创。

我院生物中间博士后官健涛、徐摇光助理研讨员和于洋助理研讨员为该论文并列第一作者，生物中间谢华研讨员、魏建华研讨员和林果所姜全研讨员为并列通信作者。该研讨获得国度重点研发筹划“次要经济作物优质高产与家当提质增效科技立异”名目（2018YFD1000200）、院基因组协同立异名目 （KJCX201907-2）。(100yiyao.com）