我国迷信家开辟新技术,极年夜进步单细胞测序性能 |
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单细胞全基因组测序(WGS)关于表征DNA中动静细胞间变动至关紧张。以后用于单细胞WGS的样品制备技术简单,低廉,而且存在高扩增偏差和误差。
厦门年夜学杨朝勇团队在Science Advances 在线颁发题为“Digital-WGS: Automated, highly efficient whole-genome sequencing of single cells by digital microfluidics”的研讨论文,该研讨描写了Digital-WGS,这是一个样品前处置平台,可基于数字微流体的自动处置功效来简化高性能单细胞WGS。
数字微流控(DMF)是一种新兴的微流控自动化技术,可通过电介质上电润湿征象处置电极阵列上微升至纳升年夜小的液滴。该研讨开辟了Digital-WGS,这是一种基于DMF的单细胞样品制备平台,该平台集成了并行纳升体积多重置换扩增(MDA)的一切次要步调,包含从单细胞拆散到全基因组扩增(WGA)的自动处置。通过在DMF芯片上联合流体能源学和外表润湿性,无论细胞类型和输出若何,都可以通过液滴操作自动无效地(100%)拆散单个细胞。Digital-WGS许可在一切步调中对液滴进行可寻址的节制,以年夜年夜进步裂解效率和反馈的平均性。可寻址和非打仗式任务流程削减了与净化物或内源性配景的竞争,从而进步了基因组模板的无效浓度。
该研讨利用Digital-WGS进行了许多单细胞纳升体积的MDA反馈,并使用低深度和深度全基因组测序将性能与其他已报道的MDA办法进行了全面比拟。该成果标明,Digital-WGS在多个方面都优于现有的MDA办法,从而年夜年夜下降了缩小偏差和指数缩小误差。使用该办法,该研讨可能以最小的150 kb bin和等位基因剔除(ADO)率为5.2%的单核苷酸变体完成精彩的检测。是以,Digital-WGS提供相识决WGA以后成绩的共同路径,从而为执行单细胞测序提供了一种无效而弱小的办法。这种办法关于单细胞阐发的任何化学办法都具备可扩大性和通用性,这关于单细胞基因组测序有广大的利用前景。(100yiyao.com)
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